RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-211	ENST00000590874	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		40.97	■■■■■ 4.15
CAPNS1-211	ENST00000590874	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.95	■■■■■ 4.15
CAPNS1-211	ENST00000590874	TNR	Q92752	1358 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CAPNS1-211	ENST00000590874	PZP	P20742	1482 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CAPNS1-211	ENST00000590874	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CAPNS1-211	ENST00000590874	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CAPNS1-211	ENST00000590874	ILDR2	Q71H61	639 aa		40.91	■■■■■ 4.14
CAPNS1-211	ENST00000590874	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CAPNS1-211	ENST00000590874	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CAPNS1-211	ENST00000590874	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.88	■■■■■ 4.13
CAPNS1-211	ENST00000590874	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.85	■■■■■ 4.13
CAPNS1-211	ENST00000590874	TSPY4	P0CV99	314 aa		40.84	■■■■■ 4.13
CAPNS1-211	ENST00000590874	TSPY10	P0CW01	314 aa		40.84	■■■■■ 4.13
CAPNS1-211	ENST00000590874	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.83	■■■■■ 4.13
CAPNS1-211	ENST00000590874	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CAPNS1-211	ENST00000590874	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		40.8	■■■■■ 4.12
CAPNS1-211	ENST00000590874	MIA2	Q96PC5	1412 aa		40.76	■■■■■ 4.12
CAPNS1-211	ENST00000590874	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
CAPNS1-211	ENST00000590874	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		40.74	■■■■■ 4.11
CAPNS1-211	ENST00000590874	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	40.74	■■■■■ 4.11
CAPNS1-211	ENST00000590874	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.73	■■■■■ 4.11
CAPNS1-211	ENST00000590874	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CAPNS1-211	ENST00000590874	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
CAPNS1-211	ENST00000590874	ABCC3	O15438	1527 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	MAP3K1	Q13233	1512 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.68	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.66	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		40.66	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.65	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	CPS1	P31327	1500 aa		40.64	■■■■■ 4.1
CAPNS1-211	ENST00000590874	SOCS7	O14512	581 aa		40.63	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.62	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	MED14	O60244	1454 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CAPNS1-211	ENST00000590874	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.56	■■■■■ 4.08
CAPNS1-211	ENST00000590874	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CAPNS1-211	ENST00000590874	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
CAPNS1-211	ENST00000590874	PIP4K2B	P78356	416 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CAPNS1-211	ENST00000590874	CEP152	O94986	1710 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CAPNS1-211	ENST00000590874	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.47	■■■■■ 4.07
CAPNS1-211	ENST00000590874	TOM1	O60784	492 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CAPNS1-211	ENST00000590874	HSPA1L	P34931	641 aa		40.44	■■■■■ 4.06
CAPNS1-211	ENST00000590874	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CAPNS1-211	ENST00000590874	ABCC5	O15440	1437 aa		40.42	■■■■■ 4.06
CAPNS1-211	ENST00000590874	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.4	■■■■■ 4.06
CAPNS1-211	ENST00000590874	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CAPNS1-211	ENST00000590874	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CAPNS1-211	ENST00000590874	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CAPNS1-211	ENST00000590874	ALK	Q9UM73	1620 aa		40.37	■■■■■ 4.05
CAPNS1-211	ENST00000590874	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CAPNS1-211	ENST00000590874	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CAPNS1-211	ENST00000590874	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CAPNS1-211	ENST00000590874	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		40.33	■■■■■ 4.05
CAPNS1-211	ENST00000590874	DAPK1	P53355	1430 aa		40.32	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.27	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	APLP2	Q06481	763 aa		40.27	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	40.27	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		40.26	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.26	■■■■■ 4.04
CAPNS1-211	ENST00000590874	SLIT1	O75093	1534 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CAPNS1-211	ENST00000590874	SYNM	O15061	1565 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CAPNS1-211	ENST00000590874	LTK	P29376	864 aa		40.24	■■■■■ 4.03
CAPNS1-211	ENST00000590874	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CAPNS1-211	ENST00000590874	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CAPNS1-211	ENST00000590874	KANK1	Q14678	1352 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CAPNS1-211	ENST00000590874	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CAPNS1-211	ENST00000590874	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.14	■■■■■ 4.02
CAPNS1-211	ENST00000590874	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.13	■■■■■ 4.01
CAPNS1-211	ENST00000590874	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.1	■■■■■ 4.01
CAPNS1-211	ENST00000590874	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.1	■■■■■ 4.01
CAPNS1-211	ENST00000590874	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	40.08	■■■■■ 4.01
CAPNS1-211	ENST00000590874	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.05	■■■■■ 4
CAPNS1-211	ENST00000590874	IDI1	Q13907	227 aa		40.04	■■■■■ 4
CAPNS1-211	ENST00000590874	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.04	■■■■■ 4
CAPNS1-211	ENST00000590874	ADGRL2	O95490	1459 aa		40	■■■■□ 3.99
CAPNS1-211	ENST00000590874	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40	■■■■□ 3.99
CAPNS1-211	ENST00000590874	NOS1	P29475	1434 aa		39.99	■■■■□ 3.99
CAPNS1-211	ENST00000590874	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	39.97	■■■■□ 3.99
CAPNS1-211	ENST00000590874	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	39.94	■■■■□ 3.98
CAPNS1-211	ENST00000590874	ADGRB3	O60242	1522 aa		39.92	■■■■□ 3.98
CAPNS1-211	ENST00000590874	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	39.91	■■■■□ 3.98
CAPNS1-211	ENST00000590874	TET3	O43151	1660 aa		39.89	■■■■□ 3.98
CAPNS1-211	ENST00000590874	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		39.87	■■■■□ 3.97
CAPNS1-211	ENST00000590874	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		39.87	■■■■□ 3.97
CAPNS1-211	ENST00000590874	TMEM94	Q12767	1356 aa		39.86	■■■■□ 3.97
CAPNS1-211	ENST00000590874	KCNA6	P17658	529 aa		39.85	■■■■□ 3.97
CAPNS1-211	ENST00000590874	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		39.83	■■■■□ 3.97
CAPNS1-211	ENST00000590874	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	39.81	■■■■□ 3.96
CAPNS1-211	ENST00000590874	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		39.79	■■■■□ 3.96
CAPNS1-211	ENST00000590874	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	39.78	■■■■□ 3.96
CAPNS1-211	ENST00000590874	NWD1	Q149M9	1564 aa		39.76	■■■■□ 3.95
CAPNS1-211	ENST00000590874	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	39.75	■■■■□ 3.95

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