RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590720.5

PSME3-210, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-210ENST00000590720 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.04■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.03■■■□□ 2.72
PSME3-210ENST00000590720 PLA2R1Q13018 1463 aa31.95■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 PZPP20742 1482 aa31.94■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 A2ML1A8K2U0 1454 aa31.91■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 APLP2Q06481 763 aa31.91■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa31.91■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.9■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.89■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
PSME3-210ENST00000590720 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.87■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 PTPN23Q9H3S7 1636 aa31.87■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 TNRQ92752 1358 aa31.87■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP31.87■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 PKD2Q13563 968 aa31.84■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 SHANK2Q9UPX8 1470 aa31.83■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 MROH1Q8NDA8 1641 aa31.82■■■□□ 2.69
PSME3-210ENST00000590720 ABCC3O15438 1527 aa31.82■■■□□ 2.68
PSME3-210ENST00000590720 DUOX2Q9NRD8 1548 aa31.82■■■□□ 2.68
PSME3-210ENST00000590720 ABCC5O15440 1437 aa31.8■■■□□ 2.68
PSME3-210ENST00000590720 FGD6Q6ZV73 1430 aa31.79■■■□□ 2.68
PSME3-210ENST00000590720 IQSEC2Q5JU85 1478 aa31.77■■■□□ 2.68
PSME3-210ENST00000590720 DAPK1P53355 1430 aa31.75■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 NLRP1Q9C000 1473 aa31.75■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 CEP152O94986 1710 aa31.75■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 KIF15Q9NS87 1388 aa31.74■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa31.73■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 ERBINQ96RT1 1412 aa31.72■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 NEURL4Q96JN8 1562 aa31.71■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.7■■■□□ 2.67
PSME3-210ENST00000590720 ERVK-7P63135 1459 aa31.68■■■□□ 2.66
PSME3-210ENST00000590720 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.67■■■□□ 2.66
PSME3-210ENST00000590720 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP31.66■■■□□ 2.66
PSME3-210ENST00000590720 DEPDC5O75140 1603 aa31.64■■■□□ 2.65
PSME3-210ENST00000590720 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
PSME3-210ENST00000590720 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.59■■■□□ 2.65
PSME3-210ENST00000590720 ANKLE2Q86XL3 938 aa31.58■■■□□ 2.65
PSME3-210ENST00000590720 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.58■■■□□ 2.65
PSME3-210ENST00000590720 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.57■■■□□ 2.64
PSME3-210ENST00000590720 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
PSME3-210ENST00000590720 MED14O60244 1454 aa31.55■■■□□ 2.64
PSME3-210ENST00000590720 ADGRL2O95490 1459 aa31.53■■■□□ 2.64
PSME3-210ENST00000590720 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.53■■■□□ 2.64
PSME3-210ENST00000590720 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
PSME3-210ENST00000590720 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP31.52■■■□□ 2.642e-7■■■□□ 16.9
PSME3-210ENST00000590720 KANK1Q14678 1352 aa31.51■■■□□ 2.63
PSME3-210ENST00000590720 IQGAP1P46940 1657 aa31.51■■■□□ 2.63
PSME3-210ENST00000590720 VWDEQ8N2E2 1590 aa31.5■■■□□ 2.63
PSME3-210ENST00000590720 CPS1P31327 1500 aa31.49■■■□□ 2.63
PSME3-210ENST00000590720 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
PSME3-210ENST00000590720 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.49■■■□□ 2.63
PSME3-210ENST00000590720 UBAP1LF5GYI3 381 aa31.45■■■□□ 2.63
PSME3-210ENST00000590720 PIK3C2BO00750 1634 aa31.41■■■□□ 2.62
PSME3-210ENST00000590720 SLIT1O75093 1534 aa31.4■■■□□ 2.62
PSME3-210ENST00000590720 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.4■■■□□ 2.62
PSME3-210ENST00000590720 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.39■■■□□ 2.62
PSME3-210ENST00000590720 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
PSME3-210ENST00000590720 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.37■■■□□ 2.61
PSME3-210ENST00000590720 SYNMO15061 1565 aa31.35■■■□□ 2.61
PSME3-210ENST00000590720 STRCP1A6NGW2 1772 aa31.33■■■□□ 2.61
PSME3-210ENST00000590720 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
PSME3-210ENST00000590720 NOS1P29475 1434 aa31.31■■■□□ 2.6
PSME3-210ENST00000590720 DISP3Q9P2K9 1392 aa31.3■■■□□ 2.6
PSME3-210ENST00000590720 LTKP29376 864 aa31.3■■■□□ 2.6
PSME3-210ENST00000590720 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.29■■■□□ 2.6
PSME3-210ENST00000590720 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.28■■■□□ 2.6
PSME3-210ENST00000590720 UNC13BO14795 1591 aa31.26■■■□□ 2.6
PSME3-210ENST00000590720 IDI1Q13907 227 aa31.26■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.26■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 TET3O43151 1660 aa31.25■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 TOM1O60784 492 aa31.25■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 EID1Q9Y6B2 187 aa31.25■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 ADGRB3O60242 1522 aa31.24■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.24■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 ROCK1Q13464 1354 aa31.23■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 ALKQ9UM73 1620 aa31.21■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 PIP4K2BP78356 416 aa31.21■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.21■■■□□ 2.59
PSME3-210ENST00000590720 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
PSME3-210ENST00000590720 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.17■■■□□ 2.58
PSME3-210ENST00000590720 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.13■■■□□ 2.57
PSME3-210ENST00000590720 HSPA1LP34931 641 aa31.12■■■□□ 2.57
PSME3-210ENST00000590720 E9PCH4 1651 aa31.12■■■□□ 2.57
PSME3-210ENST00000590720 ITGAEP38570 1179 aa31.11■■■□□ 2.57
PSME3-210ENST00000590720 ILDR2Q71H61 639 aa31.1■■■□□ 2.57
PSME3-210ENST00000590720 MYO5BQ9ULV0 1848 aa31.09■■■□□ 2.57
PSME3-210ENST00000590720 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
PSME3-210ENST00000590720 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.06■■■□□ 2.56
PSME3-210ENST00000590720 ZFYVE9O95405 1425 aa31.05■■■□□ 2.56
PSME3-210ENST00000590720 SLC26A8Q96RN1 970 aa31.02■■■□□ 2.56
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