RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.83■■□□□ 1.57
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.82■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.82■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.81■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF15Q9NS87 1388 aa24.8■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPRKQ15262 1439 aa24.79■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.79■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.79■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.78■■□□□ 1.56
EFTUD2-215ENST00000589825 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
EFTUD2-215ENST00000589825 ERBINQ96RT1 1412 aa24.74■■□□□ 1.55
EFTUD2-215ENST00000589825 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
EFTUD2-215ENST00000589825 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.72■■□□□ 1.55
EFTUD2-215ENST00000589825 PZPP20742 1482 aa24.72■■□□□ 1.55
EFTUD2-215ENST00000589825 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 STRCQ7RTU9 1775 aa24.7■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 TNRQ92752 1358 aa24.69■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.543e-7■■■■□ 21.7
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.68■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCC3O15438 1527 aa24.67■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 NCOA1Q15788 1441 aa24.67■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 KANK1Q14678 1352 aa24.67■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.64■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 CEP152O94986 1710 aa24.64■■□□□ 1.54
EFTUD2-215ENST00000589825 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.64■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGRL2O95490 1459 aa24.64■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPRTO14522 1441 aa24.61■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 PKD2Q13563 968 aa24.6■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGAEP38570 1179 aa24.59■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.59■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 PLA2R1Q13018 1463 aa24.58■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 NLRP1Q9C000 1473 aa24.58■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 DEPDC5O75140 1603 aa24.58■■□□□ 1.53
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.56■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXO41Q8TF61 875 aa24.56■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ERVK-7P63135 1459 aa24.55■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.54■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 CERKQ8TCT0 537 aa24.54■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.52■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.52■■□□□ 1.52
EFTUD2-215ENST00000589825 ROCK1Q13464 1354 aa24.51■■□□□ 1.51
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.49■■□□□ 1.51
EFTUD2-215ENST00000589825 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.47■■□□□ 1.51
EFTUD2-215ENST00000589825 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
EFTUD2-215ENST00000589825 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.46■■□□□ 1.51
EFTUD2-215ENST00000589825 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.44■■□□□ 1.5
EFTUD2-215ENST00000589825 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
EFTUD2-215ENST00000589825 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.4■■□□□ 1.5
EFTUD2-215ENST00000589825 UNC13BO14795 1591 aa24.38■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.38■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 TET3O43151 1660 aa24.36■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.35■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.35■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 EID1Q9Y6B2 187 aa24.34■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.34■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 NUP155O75694 1391 aa24.33■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 PIK3C2BO00750 1634 aa24.33■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 IDI1Q13907 227 aa24.33■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.33■■□□□ 1.49
EFTUD2-215ENST00000589825 NOS1P29475 1434 aa24.32■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 MED14O60244 1454 aa24.32■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.31■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 SYNMO15061 1565 aa24.3■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 IQGAP1P46940 1657 aa24.3■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.29■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.29■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 SLIT1O75093 1534 aa24.27■■□□□ 1.48
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.26■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.25■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 LTKP29376 864 aa24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 E9PCH4 1651 aa24.24■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGRB3O60242 1522 aa24.23■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 CPS1P31327 1500 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 NAIPQ13075 1403 aa24.22■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
EFTUD2-215ENST00000589825 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIM52Q96A61 297 aa24.19■■□□□ 1.46
EFTUD2-215ENST00000589825 BCANQ96GW7 911 aa24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-215ENST00000589825 HFM1A2PYH4 1435 aa24.18■■□□□ 1.46
EFTUD2-215ENST00000589825 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.17■■□□□ 1.46
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
EFTUD2-215ENST00000589825 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.13■■□□□ 1.45
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
EFTUD2-215ENST00000589825 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.1■■□□□ 1.45
EFTUD2-215ENST00000589825 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms