RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589054.5

NEDD4L-225, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3 BASIC

Gene NEDD4L, Length 1,033 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.8	■■■■□ 3
NEDD4L-225	ENST00000589054	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.77	■■■■□ 3
NEDD4L-225	ENST00000589054	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.76	■■■■□ 3
NEDD4L-225	ENST00000589054	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.76	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.76	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.74	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	PKD2	Q13563	968 aa		33.74	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.74	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	PZP	P20742	1482 aa		33.73	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	TNR	Q92752	1358 aa		33.72	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.71	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.71	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.7	■■■□□ 2.99
NEDD4L-225	ENST00000589054	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.65	■■■□□ 2.98
NEDD4L-225	ENST00000589054	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
NEDD4L-225	ENST00000589054	ABCC5	O15440	1437 aa		33.6	■■■□□ 2.97
NEDD4L-225	ENST00000589054	ABCC3	O15438	1527 aa		33.59	■■■□□ 2.97
NEDD4L-225	ENST00000589054	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.59	■■■□□ 2.97
NEDD4L-225	ENST00000589054	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.58	■■■□□ 2.97	2e-19	■■■■■ 288.6
NEDD4L-225	ENST00000589054	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.57	■■■□□ 2.97
NEDD4L-225	ENST00000589054	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.55	■■■□□ 2.96
NEDD4L-225	ENST00000589054	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.52	■■■□□ 2.96
NEDD4L-225	ENST00000589054	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.51	■■■□□ 2.96
NEDD4L-225	ENST00000589054	APLP2	Q06481	763 aa		33.51	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.5	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.49	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.49	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.49	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.48	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.47	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.47	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.47	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.47	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	DAPK1	P53355	1430 aa		33.46	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.45	■■■□□ 2.95
NEDD4L-225	ENST00000589054	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.44	■■■□□ 2.94
NEDD4L-225	ENST00000589054	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.43	■■■□□ 2.94
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
NEDD4L-225	ENST00000589054	CEP152	O94986	1710 aa		33.42	■■■□□ 2.94
NEDD4L-225	ENST00000589054	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.42	■■■□□ 2.94
NEDD4L-225	ENST00000589054	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.41	■■■□□ 2.94
NEDD4L-225	ENST00000589054	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.38	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.38	■■■□□ 2.93	8e-7	■■■□□ 14.8
NEDD4L-225	ENST00000589054	MED14	O60244	1454 aa		33.37	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.37	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.35	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.35	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.34	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.33	■■■□□ 2.93
NEDD4L-225	ENST00000589054	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.32	■■■□□ 2.92
NEDD4L-225	ENST00000589054	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.32	■■■□□ 2.92
NEDD4L-225	ENST00000589054	LTK	P29376	864 aa		33.28	■■■□□ 2.92
NEDD4L-225	ENST00000589054	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.28	■■■□□ 2.92
NEDD4L-225	ENST00000589054	CPS1	P31327	1500 aa		33.27	■■■□□ 2.92
NEDD4L-225	ENST00000589054	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.25	■■■□□ 2.91
NEDD4L-225	ENST00000589054	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
NEDD4L-225	ENST00000589054	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.22	■■■□□ 2.91
NEDD4L-225	ENST00000589054	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.21	■■■□□ 2.91
NEDD4L-225	ENST00000589054	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.2	■■■□□ 2.91
NEDD4L-225	ENST00000589054	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.19	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.19	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	KANK1	Q14678	1352 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.18	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.17	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	IDI1	Q13907	227 aa		33.17	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	HSPA1L	P34931	641 aa		33.16	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	SLIT1	O75093	1534 aa		33.16	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	TOM1	O60784	492 aa		33.14	■■■□□ 2.9
NEDD4L-225	ENST00000589054	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.13	■■■□□ 2.89
NEDD4L-225	ENST00000589054	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.12	■■■□□ 2.89
NEDD4L-225	ENST00000589054	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NEDD4L-225	ENST00000589054	NOS1	P29475	1434 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NEDD4L-225	ENST00000589054	SYNM	O15061	1565 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NEDD4L-225	ENST00000589054	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.08	■■■□□ 2.89
NEDD4L-225	ENST00000589054	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.05	■■■□□ 2.88
NEDD4L-225	ENST00000589054	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.03	■■■□□ 2.88
NEDD4L-225	ENST00000589054	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.03	■■■□□ 2.88
NEDD4L-225	ENST00000589054	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
NEDD4L-225	ENST00000589054	SOCS7	O14512	581 aa		32.96	■■■□□ 2.87
NEDD4L-225	ENST00000589054	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.94	■■■□□ 2.86
NEDD4L-225	ENST00000589054	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.93	■■■□□ 2.86
NEDD4L-225	ENST00000589054	TET3	O43151	1660 aa		32.92	■■■□□ 2.86
NEDD4L-225	ENST00000589054	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
NEDD4L-225	ENST00000589054	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
NEDD4L-225	ENST00000589054	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.91	■■■□□ 2.86
NEDD4L-225	ENST00000589054	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.88	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	ITGAE	P38570	1179 aa		32.86	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	UNC13B	O14795	1591 aa		32.85	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	KCNA6	P17658	529 aa		32.85	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.84	■■■□□ 2.85
NEDD4L-225	ENST00000589054	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.83	■■■□□ 2.85

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