RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 SIN3AQ96ST3 1273 aa38.02■■■■□ 3.68
SCAMP4-210ENST00000588555 A2MP01023 1474 aa38.02■■■■□ 3.68
SCAMP4-210ENST00000588555 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.01■■■■□ 3.68
SCAMP4-210ENST00000588555 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.01■■■■□ 3.67
SCAMP4-210ENST00000588555 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
SCAMP4-210ENST00000588555 FOXD1Q16676 465 aa37.97■■■■□ 3.67
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.95■■■■□ 3.67
SCAMP4-210ENST00000588555 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.94■■■■□ 3.66
SCAMP4-210ENST00000588555 PKD2Q13563 968 aa37.93■■■■□ 3.66
SCAMP4-210ENST00000588555 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.91■■■■□ 3.66
SCAMP4-210ENST00000588555 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.91■■■■□ 3.66
SCAMP4-210ENST00000588555 NEUROD1Q13562 356 aa37.9■■■■□ 3.66
SCAMP4-210ENST00000588555 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.9■■■■□ 3.66
SCAMP4-210ENST00000588555 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.89■■■■□ 3.66
SCAMP4-210ENST00000588555 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.88■■■■□ 3.65
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF3BO15066 747 aa37.88■■■■□ 3.65
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
SCAMP4-210ENST00000588555 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.85■■■■□ 3.65
SCAMP4-210ENST00000588555 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.83■■■■□ 3.65
SCAMP4-210ENST00000588555 REREQ9P2R6 1566 aa37.77■■■■□ 3.64
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP10AO60312 1499 aa37.76■■■■□ 3.64
SCAMP4-210ENST00000588555 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.76■■■■□ 3.64
SCAMP4-210ENST00000588555 KANK1Q14678 1352 aa37.75■■■■□ 3.63
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.74■■■■□ 3.63
SCAMP4-210ENST00000588555 TET3O43151 1660 aa37.74■■■■□ 3.63
SCAMP4-210ENST00000588555 TONSLQ96HA7 1378 aa37.71■■■■□ 3.63
SCAMP4-210ENST00000588555 E9PCH4 1651 aa37.69■■■■□ 3.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.68■■■■□ 3.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PLA2R1Q13018 1463 aa37.66■■■■□ 3.62
SCAMP4-210ENST00000588555 AGLP35573 1532 aa37.64■■■■□ 3.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP152O94986 1710 aa37.63■■■■□ 3.61
SCAMP4-210ENST00000588555 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.61■■■■□ 3.61
SCAMP4-210ENST00000588555 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.61■■■■□ 3.61
SCAMP4-210ENST00000588555 GGT6Q6P531 493 aa37.6■■■■□ 3.61
SCAMP4-210ENST00000588555 ABCC3O15438 1527 aa37.58■■■■□ 3.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.61
SCAMP4-210ENST00000588555 PTPRTO14522 1441 aa37.53■■■■□ 3.6
SCAMP4-210ENST00000588555 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.53■■■■□ 3.6
SCAMP4-210ENST00000588555 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.52■■■■□ 3.6
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.51■■■■□ 3.6
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPM2O94759 1503 aa37.5■■■■□ 3.59
SCAMP4-210ENST00000588555 L3MBTL2Q969R5 705 aa37.5■■■■□ 3.59
SCAMP4-210ENST00000588555 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.48■■■■□ 3.59
SCAMP4-210ENST00000588555 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.48■■■■□ 3.59
SCAMP4-210ENST00000588555 NPATQ14207 1427 aa37.44■■■■□ 3.58
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.38■■■■□ 3.57
SCAMP4-210ENST00000588555 CLTCL1P53675 1640 aa37.37■■■■□ 3.57
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.36■■■■□ 3.57
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.29■■■■□ 3.56
SCAMP4-210ENST00000588555 NOS1P29475 1434 aa37.28■■■■□ 3.56
SCAMP4-210ENST00000588555 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.28■■■■□ 3.56
SCAMP4-210ENST00000588555 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.27■■■■□ 3.56
SCAMP4-210ENST00000588555 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.26■■■■□ 3.56
SCAMP4-210ENST00000588555 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.23■■■■□ 3.55
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
SCAMP4-210ENST00000588555 MLECQ14165 292 aa37.23■■■■□ 3.55
SCAMP4-210ENST00000588555 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.22■■■■□ 3.55
SCAMP4-210ENST00000588555 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.21■■■■□ 3.55
SCAMP4-210ENST00000588555 SYNMO15061 1565 aa37.2■■■■□ 3.55
SCAMP4-210ENST00000588555 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.19■■■■□ 3.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
SCAMP4-210ENST00000588555 RGL3Q3MIN7 710 aa37.17■■■■□ 3.54
SCAMP4-210ENST00000588555 PIK3C2BO00750 1634 aa37.17■■■■□ 3.54
SCAMP4-210ENST00000588555 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.16■■■■□ 3.54
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF1BO60333 1816 aa37.16■■■■□ 3.54
SCAMP4-210ENST00000588555 ERVK-7P63135 1459 aa37.11■■■■□ 3.53
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRB3O60242 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
SCAMP4-210ENST00000588555 MROH2AA6NES4 1674 aa37.1■■■■□ 3.53
SCAMP4-210ENST00000588555 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.07■■■■□ 3.53
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.06■■■■□ 3.52
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.05■■■■□ 3.52
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
SCAMP4-210ENST00000588555 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.03■■■■□ 3.52
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
SCAMP4-210ENST00000588555 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
SCAMP4-210ENST00000588555 ZMYM3Q14202 1370 aa37.03■■■■□ 3.52
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37■■■■□ 3.51
SCAMP4-210ENST00000588555 IFT172Q9UG01 1749 aa36.99■■■■□ 3.51
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.97■■■■□ 3.51
SCAMP4-210ENST00000588555 IDI1Q13907 227 aa36.96■■■■□ 3.51
SCAMP4-210ENST00000588555 STAC3Q96MF2 364 aa36.96■■■■□ 3.51
SCAMP4-210ENST00000588555 MADDQ8WXG6 1647 aa36.96■■■■□ 3.51
SCAMP4-210ENST00000588555 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.94■■■■□ 3.5
SCAMP4-210ENST00000588555 MYOM2P54296 1465 aa36.92■■■■□ 3.5
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa36.9■■■■□ 3.5
SCAMP4-210ENST00000588555 CHGAP10645 457 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
SCAMP4-210ENST00000588555 PPLO60437 1756 aa36.89■■■■□ 3.5
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP36.86■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 MYO5BQ9ULV0 1848 aa36.84■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 C3P01024 1663 aa36.84■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.84■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.83■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.83■■■■□ 3.49
SCAMP4-210ENST00000588555 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.81■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 LAMC1P11047 1609 aa36.8■■■■□ 3.48
SCAMP4-210ENST00000588555 TNRQ92752 1358 aa36.78■■■■□ 3.48
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