RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 CROCC2H7BZ55 1655 aa10.4□□□□□ -0.74
EFTUD2-211ENST00000588374 PLXNC1O60486 1568 aa10.38□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa10.37□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.36□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.753e-7■■■■□ 21.1
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF15Q9NS87 1388 aa10.36□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.35□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 C3P01024 1663 aa10.35□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 DUOX2Q9NRD8 1548 aa10.35□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.35□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRKQ15262 1439 aa10.34□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 NCOA1Q15788 1441 aa10.34□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYM3Q14202 1370 aa10.34□□□□□ -0.75
EFTUD2-211ENST00000588374 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.33□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTLNQ9NXG0 1405 aa10.33□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 MROH2AA6NES4 1674 aa10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 ADGRL2O95490 1459 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 HSPA2P54652 639 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP152O94986 1710 aa10.3□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 ERBINQ96RT1 1412 aa10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 PREX1Q8TCU6 1659 aa10.28□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 ROCK1Q13464 1354 aa10.27□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 KANK1Q14678 1352 aa10.27□□□□□ -0.76
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF39Q9H2S5 420 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 KDM5DQ9BY66 1539 aa10.27□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.26□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 LMTK3Q96Q04 1460 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCC3O15438 1527 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 DEPDC5O75140 1603 aa10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 NPATQ14207 1427 aa10.24□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 PZPP20742 1482 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM135AQ9P2D6 1515 aa10.23□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM52Q96A61 297 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 NUP155O75694 1391 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 TNRQ92752 1358 aa10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
EFTUD2-211ENST00000588374 NAIPQ13075 1403 aa10.21□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 VWDEQ8N2E2 1590 aa10.2□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 GCC2Q8IWJ2 1684 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO3AQ8NEV4 1616 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 UNC13BO14795 1591 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 STRCQ7RTU9 1775 aa10.19□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 ERVK-7P63135 1459 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 LMTK2Q8IWU2 1503 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 IDI1Q13907 227 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 STAG3Q9UJ98 1225 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 TET3O43151 1660 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 A2ML1A8K2U0 1454 aa10.17□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 HFM1A2PYH4 1435 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 E9PCH4 1651 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.16□□□□□ -0.78
EFTUD2-211ENST00000588374 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.15□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 UGGT1Q9NYU2 1555 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKLE2Q86XL3 938 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 NLRP1Q9C000 1473 aa10.14□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 PKD2Q13563 968 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC52A1Q9NWF4 448 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 PIK3C2BO00750 1634 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 SYNMO15061 1565 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 UBR1Q8IWV7 1749 aa10.13□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 NOS1P29475 1434 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.12□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 MPHOSPH9Q99550 1183 aa10.11□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 LTKP29376 864 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 EID1Q9Y6B2 187 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 PLA2R1Q13018 1463 aa10.09□□□□□ -0.79
EFTUD2-211ENST00000588374 PTPRTO14522 1441 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 BCANQ96GW7 911 aa10.08□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 HDGFP51858 240 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms