RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 KIF3BO15066 747 aa28.89■■■□□ 2.22
CTIF-206ENST00000588345 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CTIF-206ENST00000588345 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.87■■■□□ 2.21
CTIF-206ENST00000588345 PLA2R1Q13018 1463 aa28.85■■■□□ 2.21
CTIF-206ENST00000588345 PZPP20742 1482 aa28.81■■■□□ 2.2
CTIF-206ENST00000588345 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.79■■■□□ 2.2
CTIF-206ENST00000588345 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CTIF-206ENST00000588345 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.78■■■□□ 2.2
CTIF-206ENST00000588345 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CTIF-206ENST00000588345 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
CTIF-206ENST00000588345 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.77■■■□□ 2.2
CTIF-206ENST00000588345 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.75■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 PKD2Q13563 968 aa28.75■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 APLP2Q06481 763 aa28.74■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 TNRQ92752 1358 aa28.74■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.71■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.71■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.7■■■□□ 2.19
CTIF-206ENST00000588345 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.7■■■□□ 2.18
CTIF-206ENST00000588345 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.69■■■□□ 2.18
CTIF-206ENST00000588345 ABCC3O15438 1527 aa28.69■■■□□ 2.18
CTIF-206ENST00000588345 DUOX2Q9NRD8 1548 aa28.69■■■□□ 2.18
CTIF-206ENST00000588345 ABCC5O15440 1437 aa28.67■■■□□ 2.18
CTIF-206ENST00000588345 NLRP1Q9C000 1473 aa28.66■■■□□ 2.18
CTIF-206ENST00000588345 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.65■■■□□ 2.18
CTIF-206ENST00000588345 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.62■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 KIF15Q9NS87 1388 aa28.62■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 DAPK1P53355 1430 aa28.61■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 ERBINQ96RT1 1412 aa28.6■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.59■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 CEP152O94986 1710 aa28.59■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.58■■■□□ 2.17
CTIF-206ENST00000588345 ERVK-7P63135 1459 aa28.56■■■□□ 2.16
CTIF-206ENST00000588345 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
CTIF-206ENST00000588345 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.169e-7■■□□□ 13.7
CTIF-206ENST00000588345 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.53■■■□□ 2.16
CTIF-206ENST00000588345 DEPDC5O75140 1603 aa28.53■■■□□ 2.16
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.51■■■□□ 2.15
CTIF-206ENST00000588345 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.5■■■□□ 2.15
CTIF-206ENST00000588345 MED14O60244 1454 aa28.49■■■□□ 2.15
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.49■■■□□ 2.15
CTIF-206ENST00000588345 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CTIF-206ENST00000588345 ADGRL2O95490 1459 aa28.45■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.43■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.43■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 CPS1P31327 1500 aa28.43■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.42■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.42■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 KANK1Q14678 1352 aa28.4■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 IQGAP1P46940 1657 aa28.4■■■□□ 2.14
CTIF-206ENST00000588345 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
CTIF-206ENST00000588345 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.35■■■□□ 2.13
CTIF-206ENST00000588345 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.34■■■□□ 2.13
CTIF-206ENST00000588345 SLIT1O75093 1534 aa28.33■■■□□ 2.13
CTIF-206ENST00000588345 PIK3C2BO00750 1634 aa28.3■■■□□ 2.12
CTIF-206ENST00000588345 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
CTIF-206ENST00000588345 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.29■■■□□ 2.12
CTIF-206ENST00000588345 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.28■■■□□ 2.12
CTIF-206ENST00000588345 NOS1P29475 1434 aa28.26■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 SYNMO15061 1565 aa28.25■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.25■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 LTKP29376 864 aa28.24■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.22■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.22■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 IDI1Q13907 227 aa28.21■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.21■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CTIF-206ENST00000588345 TOM1O60784 492 aa28.2■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 EID1Q9Y6B2 187 aa28.19■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.18■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 ROCK1Q13464 1354 aa28.18■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 UNC13BO14795 1591 aa28.18■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 TET3O43151 1660 aa28.18■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.16■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 ALKQ9UM73 1620 aa28.16■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 ADGRB3O60242 1522 aa28.15■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.15■■■□□ 2.1
CTIF-206ENST00000588345 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.13■■■□□ 2.09
CTIF-206ENST00000588345 PIP4K2BP78356 416 aa28.1■■■□□ 2.09
CTIF-206ENST00000588345 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CTIF-206ENST00000588345 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.07■■■□□ 2.08
CTIF-206ENST00000588345 HSPA1LP34931 641 aa28.06■■■□□ 2.08
CTIF-206ENST00000588345 ILDR2Q71H61 639 aa28.05■■■□□ 2.08
CTIF-206ENST00000588345 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CTIF-206ENST00000588345 E9PCH4 1651 aa28.04■■■□□ 2.08
CTIF-206ENST00000588345 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.02■■■□□ 2.08
CTIF-206ENST00000588345 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.01■■■□□ 2.07
CTIF-206ENST00000588345 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CTIF-206ENST00000588345 ZFYVE9O95405 1425 aa28.01■■■□□ 2.07
CTIF-206ENST00000588345 KCNA6P17658 529 aa27.97■■■□□ 2.07
CTIF-206ENST00000588345 ITGAEP38570 1179 aa27.97■■■□□ 2.07
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