RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588278.1

TPGS1-202, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Gene TPGS1, Length 2,873 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-202ENST00000588278 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.79■□□□□ 0.92
TPGS1-202ENST00000588278 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.78■□□□□ 0.92
TPGS1-202ENST00000588278 TMC1Q8TDI8 760 aa20.77■□□□□ 0.92
TPGS1-202ENST00000588278 SLC4A3P48751 1232 aa20.77■□□□□ 0.92
TPGS1-202ENST00000588278 PDE4AP27815 886 aa20.76■□□□□ 0.91
TPGS1-202ENST00000588278 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.72■□□□□ 0.91
TPGS1-202ENST00000588278 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.72■□□□□ 0.91
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TPGS1-202ENST00000588278 ADGRL2O95490 1459 aa20.67■□□□□ 0.9
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TPGS1-202ENST00000588278 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.65■□□□□ 0.9
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TPGS1-202ENST00000588278 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.62■□□□□ 0.89
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TPGS1-202ENST00000588278 CHD1O14646 1710 aa20.6■□□□□ 0.89
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TPGS1-202ENST00000588278 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.56■□□□□ 0.88
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TPGS1-202ENST00000588278 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.51■□□□□ 0.87
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TPGS1-202ENST00000588278 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.51■□□□□ 0.87
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TPGS1-202ENST00000588278 PANK3Q9H999 370 aa20.47■□□□□ 0.87
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TPGS1-202ENST00000588278 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.43■□□□□ 0.86
TPGS1-202ENST00000588278 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.43■□□□□ 0.86
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TPGS1-202ENST00000588278 NLRP13Q86W25 1043 aa20.41■□□□□ 0.86
TPGS1-202ENST00000588278 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
TPGS1-202ENST00000588278 PLA2R1Q13018 1463 aa20.41■□□□□ 0.86
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TPGS1-202ENST00000588278 ARXQ96QS3 562 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-202ENST00000588278 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-202ENST00000588278 TMF1P82094 1093 aa20.4■□□□□ 0.86
TPGS1-202ENST00000588278 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
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TPGS1-202ENST00000588278 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.38■□□□□ 0.85
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TPGS1-202ENST00000588278 RGS3P49796 1198 aa20.36■□□□□ 0.85
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TPGS1-202ENST00000588278 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.27■□□□□ 0.84
TPGS1-202ENST00000588278 C8orf34Q49A92 452 aa20.27■□□□□ 0.83
TPGS1-202ENST00000588278 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.27■□□□□ 0.83
TPGS1-202ENST00000588278 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.27■□□□□ 0.83
TPGS1-202ENST00000588278 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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TPGS1-202ENST00000588278 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.23■□□□□ 0.83
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