RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586813.5

TRAF4-216, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF4, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-216ENST00000586813 KIF3BO15066 747 aa30.79■■■□□ 2.52
TRAF4-216ENST00000586813 MAP3K1Q13233 1512 aa30.78■■■□□ 2.52
TRAF4-216ENST00000586813 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
TRAF4-216ENST00000586813 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.77■■■□□ 2.52
TRAF4-216ENST00000586813 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.76■■■□□ 2.52
TRAF4-216ENST00000586813 PZPP20742 1482 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAF4-216ENST00000586813 PKD2Q13563 968 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAF4-216ENST00000586813 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
TRAF4-216ENST00000586813 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
TRAF4-216ENST00000586813 TSPY4P0CV99 314 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAF4-216ENST00000586813 TSPY10P0CW01 314 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAF4-216ENST00000586813 TNRQ92752 1358 aa30.7■■■□□ 2.51
TRAF4-216ENST00000586813 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.68■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.68■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.67■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 MIA2Q96PC5 1412 aa30.66■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
TRAF4-216ENST00000586813 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.63■■■□□ 2.49
TRAF4-216ENST00000586813 ABCC3O15438 1527 aa30.61■■■□□ 2.49
TRAF4-216ENST00000586813 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.6■■■□□ 2.49
TRAF4-216ENST00000586813 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.59■■■□□ 2.49
TRAF4-216ENST00000586813 NLRP1Q9C000 1473 aa30.59■■■□□ 2.49
TRAF4-216ENST00000586813 CEP152O94986 1710 aa30.56■■■□□ 2.48
TRAF4-216ENST00000586813 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30.55■■■□□ 2.48
TRAF4-216ENST00000586813 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.55■■■□□ 2.48
TRAF4-216ENST00000586813 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.54■■■□□ 2.48
TRAF4-216ENST00000586813 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.52■■■□□ 2.48
TRAF4-216ENST00000586813 DEPDC5O75140 1603 aa30.51■■■□□ 2.48
TRAF4-216ENST00000586813 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.471e-7■■□□□ 12.7
TRAF4-216ENST00000586813 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 DISP3Q9P2K9 1392 aa30.5■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 ERVK-7P63135 1459 aa30.49■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 CPS1P31327 1500 aa30.47■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.46■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TRAF4-216ENST00000586813 ABCC5O15440 1437 aa30.45■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 IQGAP1P46940 1657 aa30.45■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 MED14O60244 1454 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.44■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 KIF15Q9NS87 1388 aa30.43■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 ERBINQ96RT1 1412 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 APLP2Q06481 763 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.42■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 DAPK1P53355 1430 aa30.4■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.39■■■□□ 2.46
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAF4-216ENST00000586813 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.33■■■□□ 2.45
TRAF4-216ENST00000586813 ILDR2Q71H61 639 aa30.32■■■□□ 2.44
TRAF4-216ENST00000586813 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.31■■■□□ 2.44
TRAF4-216ENST00000586813 SYNMO15061 1565 aa30.27■■■□□ 2.44
TRAF4-216ENST00000586813 PIK3C2BO00750 1634 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 SLIT1O75093 1534 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.25■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.23■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.439e-7■■■□□ 14.9
TRAF4-216ENST00000586813 KANK1Q14678 1352 aa30.23■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 TOM1O60784 492 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 ALKQ9UM73 1620 aa30.22■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 PIP4K2BP78356 416 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.2■■■□□ 2.43
TRAF4-216ENST00000586813 ADGRL2O95490 1459 aa30.19■■■□□ 2.42
TRAF4-216ENST00000586813 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.18■■■□□ 2.42
TRAF4-216ENST00000586813 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.17■■■□□ 2.42
TRAF4-216ENST00000586813 SOCS7O14512 581 aa30.15■■■□□ 2.42
TRAF4-216ENST00000586813 HSPA1LP34931 641 aa30.15■■■□□ 2.42
TRAF4-216ENST00000586813 LTKP29376 864 aa30.13■■■□□ 2.41
TRAF4-216ENST00000586813 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.12■■■□□ 2.41
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.1■■■□□ 2.41
TRAF4-216ENST00000586813 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
TRAF4-216ENST00000586813 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
TRAF4-216ENST00000586813 EID1Q9Y6B2 187 aa30.08■■■□□ 2.41
TRAF4-216ENST00000586813 NOS1P29475 1434 aa30.07■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 ADGRB3O60242 1522 aa30.06■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.05■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 IDI1Q13907 227 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 TET3O43151 1660 aa30.03■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
TRAF4-216ENST00000586813 GCC2Q8IWJ2 1684 aa30■■■□□ 2.39
TRAF4-216ENST00000586813 UNC13BO14795 1591 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAF4-216ENST00000586813 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.99■■■□□ 2.39
TRAF4-216ENST00000586813 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.93■■■□□ 2.38
TRAF4-216ENST00000586813 NWD1Q149M9 1564 aa29.9■■■□□ 2.38
TRAF4-216ENST00000586813 E9PCH4 1651 aa29.89■■■□□ 2.38
TRAF4-216ENST00000586813 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.89■■■□□ 2.37
TRAF4-216ENST00000586813 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.87■■■□□ 2.37
TRAF4-216ENST00000586813 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
TRAF4-216ENST00000586813 ROCK1Q13464 1354 aa29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms