RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582295.1

C1QTNF1-210, Transcript of C1q and TNF related 1, humanhuman

TSL 2

Gene C1QTNF1, Length 517 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1-210ENST00000582295 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
C1QTNF1-210ENST00000582295 PZPP20742 1482 aa42.33■■■■■ 4.37
C1QTNF1-210ENST00000582295 PKD2Q13563 968 aa42.3■■■■■ 4.36
C1QTNF1-210ENST00000582295 KIF3BO15066 747 aa42.29■■■■■ 4.36
C1QTNF1-210ENST00000582295 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
C1QTNF1-210ENST00000582295 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.28■■■■■ 4.36
C1QTNF1-210ENST00000582295 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.26■■■■■ 4.36
C1QTNF1-210ENST00000582295 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
C1QTNF1-210ENST00000582295 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
C1QTNF1-210ENST00000582295 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.24■■■■■ 4.35
C1QTNF1-210ENST00000582295 TNRQ92752 1358 aa42.23■■■■■ 4.35
C1QTNF1-210ENST00000582295 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.2■■■■■ 4.35
C1QTNF1-210ENST00000582295 MAP3K1Q13233 1512 aa42.19■■■■■ 4.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.17■■■■■ 4.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.16■■■■■ 4.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 DISP3Q9P2K9 1392 aa42.14■■■■■ 4.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.34
C1QTNF1-210ENST00000582295 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 ABCC3O15438 1527 aa42.12■■■■■ 4.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.12■■■■■ 4.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 ILDR2Q71H61 639 aa42.09■■■■■ 4.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.08■■■■■ 4.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 MIA2Q96PC5 1412 aa42.08■■■■■ 4.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 NLRP1Q9C000 1473 aa42.07■■■■■ 4.33
C1QTNF1-210ENST00000582295 TSPY4P0CV99 314 aa42.06■■■■■ 4.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 TSPY10P0CW01 314 aa42.06■■■■■ 4.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.03■■■■■ 4.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 CEP152O94986 1710 aa42.02■■■■■ 4.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 DEPDC5O75140 1603 aa42.02■■■■■ 4.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.01■■■■■ 4.32
C1QTNF1-210ENST00000582295 CROCC2H7BZ55 1655 aa42■■■■■ 4.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.98■■■■■ 4.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 MED14O60244 1454 aa41.96■■■■■ 4.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 CPS1P31327 1500 aa41.95■■■■■ 4.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 ERVK-7P63135 1459 aa41.95■■■■■ 4.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.95■■■■■ 4.31
C1QTNF1-210ENST00000582295 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.92■■■■■ 4.3
C1QTNF1-210ENST00000582295 IQGAP1P46940 1657 aa41.91■■■■■ 4.3
C1QTNF1-210ENST00000582295 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
C1QTNF1-210ENST00000582295 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.87■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.86■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.86■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.85■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 ALKQ9UM73 1620 aa41.84■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 ABCC5O15440 1437 aa41.84■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
C1QTNF1-210ENST00000582295 KIF15Q9NS87 1388 aa41.78■■■■■ 4.28
C1QTNF1-210ENST00000582295 ERBINQ96RT1 1412 aa41.77■■■■■ 4.28
C1QTNF1-210ENST00000582295 SOCS7O14512 581 aa41.74■■■■■ 4.27
C1QTNF1-210ENST00000582295 DAPK1P53355 1430 aa41.73■■■■■ 4.27
C1QTNF1-210ENST00000582295 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.71■■■■■ 4.27
C1QTNF1-210ENST00000582295 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.69■■■■■ 4.27
C1QTNF1-210ENST00000582295 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.67■■■■■ 4.26
C1QTNF1-210ENST00000582295 SYNMO15061 1565 aa41.67■■■■■ 4.26
C1QTNF1-210ENST00000582295 SLIT1O75093 1534 aa41.65■■■■■ 4.26
C1QTNF1-210ENST00000582295 HSPA1LP34931 641 aa41.64■■■■■ 4.26
C1QTNF1-210ENST00000582295 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.64■■■■■ 4.26
C1QTNF1-210ENST00000582295 PIK3C2BO00750 1634 aa41.63■■■■■ 4.26
C1QTNF1-210ENST00000582295 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.63■■■■■ 4.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 PIP4K2BP78356 416 aa41.62■■■■■ 4.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 TOM1O60784 492 aa41.59■■■■■ 4.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP41.59■■■■■ 4.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
C1QTNF1-210ENST00000582295 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.56■■■■■ 4.24
C1QTNF1-210ENST00000582295 LTKP29376 864 aa41.53■■■■■ 4.24
C1QTNF1-210ENST00000582295 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
C1QTNF1-210ENST00000582295 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.48■■■■■ 4.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.46■■■■■ 4.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 APLP2Q06481 763 aa41.46■■■■■ 4.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 ADGRL2O95490 1459 aa41.46■■■■■ 4.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.45■■■■■ 4.23
C1QTNF1-210ENST00000582295 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.44■■■■■ 4.22
C1QTNF1-210ENST00000582295 KANK1Q14678 1352 aa41.41■■■■■ 4.22
C1QTNF1-210ENST00000582295 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.41■■■■■ 4.22
C1QTNF1-210ENST00000582295 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.41■■■■■ 4.22
C1QTNF1-210ENST00000582295 NOS1P29475 1434 aa41.38■■■■■ 4.22
C1QTNF1-210ENST00000582295 ADGRB3O60242 1522 aa41.34■■■■■ 4.21
C1QTNF1-210ENST00000582295 TET3O43151 1660 aa41.32■■■■■ 4.2
C1QTNF1-210ENST00000582295 IDI1Q13907 227 aa41.31■■■■■ 4.2
C1QTNF1-210ENST00000582295 EID1Q9Y6B2 187 aa41.26■■■■■ 4.2
C1QTNF1-210ENST00000582295 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.23■■■■■ 4.19
C1QTNF1-210ENST00000582295 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.21■■■■■ 4.19
C1QTNF1-210ENST00000582295 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 UNC13BO14795 1591 aa41.19■■■■■ 4.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 NWD1Q149M9 1564 aa41.19■■■■■ 4.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.17■■■■■ 4.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.16■■■■■ 4.18
C1QTNF1-210ENST00000582295 TMEM94Q12767 1356 aa41.12■■■■■ 4.17
C1QTNF1-210ENST00000582295 ZFYVE9O95405 1425 aa41.12■■■■■ 4.17
C1QTNF1-210ENST00000582295 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.11■■■■■ 4.17
C1QTNF1-210ENST00000582295 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.09■■■■■ 4.17
C1QTNF1-210ENST00000582295 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.07■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms