RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.57■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NEO1Q92859 1461 aa37.5■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DEPDC5O75140 1603 aa37.5■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NBPF8Q3BBV2 869 aa37.5■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.49■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KDM5CP41229 1560 aa37.48■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.45■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PLA2R1Q13018 1463 aa37.43■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.41■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATP10AO60312 1499 aa37.41■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.4■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.39■■■■□ 3.58
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.37■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.36■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.35■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP37.34■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.57
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KANK1Q14678 1352 aa37.32■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 E9PCH4 1651 aa37.32■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIF3BO15066 747 aa37.31■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TET3O43151 1660 aa37.31■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A2MP01023 1474 aa37.3■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.3■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RAPGEF3O95398 923 aa37.27■■■■□ 3.56
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.24■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RALGAPBQ86X10 1494 aa37.23■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ABCA6Q8N139 1617 aa37.21■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.21■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.21■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RICTORQ6R327 1708 aa37.21■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DCAF11Q8TEB1 546 aa37.2■■■■□ 3.55
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRPM2O94759 1503 aa37.19■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.18■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPRTO14522 1441 aa37.18■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.16■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa37.14■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.14■■■■□ 3.54
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.13■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.1■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.09■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.09■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 USP47Q96K76 1375 aa37.09■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RGL3Q3MIN7 710 aa37.09■■■■□ 3.53
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CEP152O94986 1710 aa37.06■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CLTCL1P53675 1640 aa37.05■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa37.03■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC7Q96M83 1385 aa37.03■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.01■■■■□ 3.52
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CARD11Q9BXL7 1154 aa37■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANP32CO43423 234 aa36.96■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.96■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.95■■■■□ 3.51
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GGT6Q6P531 493 aa36.94■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.92■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CNTLNQ9NXG0 1405 aa36.91■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ABCC3O15438 1527 aa36.91■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.91■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LAMC1P11047 1609 aa36.9■■■■□ 3.5
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STAC3Q96MF2 364 aa36.86■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NPATQ14207 1427 aa36.86■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.84■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.84■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCER2I3L3R5 266 aa36.83■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.83■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MADDQ8WXG6 1647 aa36.83■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.83■■■■□ 3.49
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIF1BO60333 1816 aa36.82■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.8■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.77■■■■□ 3.48
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 REREQ9P2R6 1566 aa36.75■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.71■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MROH2AA6NES4 1674 aa36.7■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADGRB3O60242 1522 aa36.7■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.7■■■■□ 3.47
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NOS1P29475 1434 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MYOM2P54296 1465 aa36.69■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IFT172Q9UG01 1749 aa36.68■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.67■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AGLP35573 1532 aa36.66■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.64■■■■□ 3.46
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIK3C2BO00750 1634 aa36.6■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SYNMO15061 1565 aa36.59■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IQGAP1P46940 1657 aa36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.58■■■■□ 3.45
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.5 ms