RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRM-205ENST00000577827 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRM-205ENST00000577827 SLC4A3P48751 1232 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRM-205ENST00000577827 NFKBIBQ15653 356 aa13.02□□□□□ -0.32
PTPRM-205ENST00000577827 PLCB2Q00722 1185 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA2012Q0VF49 1180 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRM-205ENST00000577827 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRM-205ENST00000577827 NRDCO43847 1150 aa13.02□□□□□ -0.33
PTPRM-205ENST00000577827 CCDC146Q8IYE0 955 aa13.02□□□□□ -0.33
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PTPRM-205ENST00000577827 STAC3Q96MF2 364 aa13□□□□□ -0.33
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PTPRM-205ENST00000577827 CCDC184Q52MB2 194 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRM-205ENST00000577827 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.87□□□□□ -0.35
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PTPRM-205ENST00000577827 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRM-205ENST00000577827 NCOA1Q15788 1441 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRM-205ENST00000577827 EVC2Q86UK5 1308 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRM-205ENST00000577827 REC8O95072 547 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRM-205ENST00000577827 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRM-205ENST00000577827 PPP2R1AP30153 589 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRM-205ENST00000577827 TRAK1Q9UPV9 953 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRM-205ENST00000577827 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRM-205ENST00000577827 ZBTB7CA1YPR0 619 aa12.8□□□□□ -0.36
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