RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574894.1

NOMO3-212, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 2

Gene NOMO3, Length 1,269 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-212ENST00000574894 HSPA2P54652 639 aa23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-212ENST00000574894 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NOMO3-212ENST00000574894 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23■■□□□ 1.27
NOMO3-212ENST00000574894 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NOMO3-212ENST00000574894 PTPRKQ15262 1439 aa22.99■■□□□ 1.27
NOMO3-212ENST00000574894 KIF15Q9NS87 1388 aa22.99■■□□□ 1.27
NOMO3-212ENST00000574894 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-212ENST00000574894 ERBINQ96RT1 1412 aa22.98■■□□□ 1.27
NOMO3-212ENST00000574894 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.97■■□□□ 1.27
NOMO3-212ENST00000574894 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 PZPP20742 1482 aa22.94■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.91■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 ADGRL2O95490 1459 aa22.9■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 ABCC3O15438 1527 aa22.89■■□□□ 1.26
NOMO3-212ENST00000574894 NCOA1Q15788 1441 aa22.89■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 TNRQ92752 1358 aa22.88■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 PTPRTO14522 1441 aa22.86■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.86■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 KANK1Q14678 1352 aa22.86■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.86■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 STRCQ7RTU9 1775 aa22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 PLA2R1Q13018 1463 aa22.85■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.83■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 NLRP1Q9C000 1473 aa22.83■■□□□ 1.25
NOMO3-212ENST00000574894 DEPDC5O75140 1603 aa22.82■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 PKD2Q13563 968 aa22.81■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.8■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.79■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 ROCK1Q13464 1354 aa22.78■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.77■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.77■■□□□ 1.24
NOMO3-212ENST00000574894 CEP152O94986 1710 aa22.77■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 ERVK-7P63135 1459 aa22.76■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 FBXO41Q8TF61 875 aa22.73■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.72■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NOMO3-212ENST00000574894 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NOMO3-212ENST00000574894 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.69■■□□□ 1.22
NOMO3-212ENST00000574894 CERKQ8TCT0 537 aa22.69■■□□□ 1.22
NOMO3-212ENST00000574894 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-212ENST00000574894 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.66■■□□□ 1.22
NOMO3-212ENST00000574894 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NOMO3-212ENST00000574894 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 UNC13BO14795 1591 aa22.63■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 ITGAEP38570 1179 aa22.63■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.6■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 TET3O43151 1660 aa22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 MED14O60244 1454 aa22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.58■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.58■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.58■■□□□ 1.21
NOMO3-212ENST00000574894 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.58■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 NOS1P29475 1434 aa22.57■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.56■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.55■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.54■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 SLIT1O75093 1534 aa22.54■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 EID1Q9Y6B2 187 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.53■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 NUP155O75694 1391 aa22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 PIK3C2BO00750 1634 aa22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NOMO3-212ENST00000574894 SYNMO15061 1565 aa22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 IDI1Q13907 227 aa22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 IQGAP1P46940 1657 aa22.5■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 CPS1P31327 1500 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.49■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 ADGRB3O60242 1522 aa22.48■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 NAIPQ13075 1403 aa22.47■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 HFM1A2PYH4 1435 aa22.46■■□□□ 1.19
NOMO3-212ENST00000574894 E9PCH4 1651 aa22.44■■□□□ 1.18
NOMO3-212ENST00000574894 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
NOMO3-212ENST00000574894 LTKP29376 864 aa22.42■■□□□ 1.18
NOMO3-212ENST00000574894 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
NOMO3-212ENST00000574894 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.35■■□□□ 1.17
NOMO3-212ENST00000574894 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
NOMO3-212ENST00000574894 ZFYVE9O95405 1425 aa22.32■■□□□ 1.16
NOMO3-212ENST00000574894 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-212ENST00000574894 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-212ENST00000574894 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-212ENST00000574894 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-212ENST00000574894 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NOMO3-212ENST00000574894 TRIM52Q96A61 297 aa22.31■■□□□ 1.16
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