RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574406.1

NLRP1-211, Transcript of NLR family pyrin domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene NLRP1, Length 1,750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1-211ENST00000574406 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
NLRP1-211ENST00000574406 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 DEPDC5O75140 1603 aa23.32■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.32■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 RAPGEF3O95398 923 aa23.3■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.3■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 RICTORQ6R327 1708 aa23.29■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 A2MP01023 1474 aa23.29■■□□□ 1.32
NLRP1-211ENST00000574406 KIF3BO15066 747 aa23.26■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.25■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.25■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 ABCA6Q8N139 1617 aa23.24■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.24■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 ATP10AO60312 1499 aa23.23■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 KANK1Q14678 1352 aa23.23■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 PLA2R1Q13018 1463 aa23.22■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 TSPOAP1O95153 1857 aa23.22■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.22■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.21■■□□□ 1.31
NLRP1-211ENST00000574406 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.2■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.2■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.2■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 TET3O43151 1660 aa23.17■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.17■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 E9PCH4 1651 aa23.15■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.14■■□□□ 1.3
NLRP1-211ENST00000574406 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.14■■□□□ 1.29
NLRP1-211ENST00000574406 PTPRTO14522 1441 aa23.12■■□□□ 1.29
NLRP1-211ENST00000574406 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.12■■□□□ 1.29
NLRP1-211ENST00000574406 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
NLRP1-211ENST00000574406 MIER1Q8N108 512 aa23.09■■□□□ 1.29
NLRP1-211ENST00000574406 TRPM2O94759 1503 aa23.08■■□□□ 1.29
NLRP1-211ENST00000574406 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.08■■□□□ 1.29
NLRP1-211ENST00000574406 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.07■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 GGT6Q6P531 493 aa23.05■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.05■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 REREQ9P2R6 1566 aa23.04■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 CEP152O94986 1710 aa23.02■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 ABCC3O15438 1527 aa23.02■■□□□ 1.28
NLRP1-211ENST00000574406 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.01■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 AGLP35573 1532 aa22.98■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.98■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 CLTCL1P53675 1640 aa22.97■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 NPATQ14207 1427 aa22.97■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.96■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 RGL3Q3MIN7 710 aa22.96■■□□□ 1.27
NLRP1-211ENST00000574406 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.95■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.95■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.94■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.93■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.93■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.91■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.91■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 STAC3Q96MF2 364 aa22.9■■□□□ 1.26
NLRP1-211ENST00000574406 USP47Q96K76 1375 aa22.89■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 NOS1P29475 1434 aa22.88■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.87■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.87■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.87■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.86■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.85■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NLRP1-211ENST00000574406 KIF1BO60333 1816 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 CCDC7Q96M83 1385 aa22.82■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 ADGRB3O60242 1522 aa22.8■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 SYNMO15061 1565 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 PIK3C2BO00750 1634 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 LAMC1P11047 1609 aa22.79■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 ANP32CO43423 234 aa22.78■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 MADDQ8WXG6 1647 aa22.78■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NLRP1-211ENST00000574406 MYOM2P54296 1465 aa22.76■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.75■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 MROH2AA6NES4 1674 aa22.75■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.75■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.75■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.74■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 IFT172Q9UG01 1749 aa22.72■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 ERVK-7P63135 1459 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.71■■□□□ 1.23
NLRP1-211ENST00000574406 MLECQ14165 292 aa22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms