RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.65■■■■■ 4.26
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.65■■■■■ 4.269e-7■■□□□ 12.2
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.63■■■■■ 4.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.61■■■■■ 4.25
CTDNEP1-208ENST00000573600 RICTORQ6R327 1708 aa41.52■■■■■ 4.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 A2MP01023 1474 aa41.51■■■■■ 4.24
CTDNEP1-208ENST00000573600 KANK1Q14678 1352 aa41.49■■■■■ 4.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.48■■■■■ 4.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP10AO60312 1499 aa41.46■■■■■ 4.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF3BO15066 747 aa41.45■■■■■ 4.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
CTDNEP1-208ENST00000573600 TET3O43151 1660 aa41.43■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCA6Q8N139 1617 aa41.43■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.43■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAPGEF3O95398 923 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 TSPOAP1O95153 1857 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.41■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.4■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLA2R1Q13018 1463 aa41.39■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 E9PCH4 1651 aa41.39■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.38■■■■■ 4.22
CTDNEP1-208ENST00000573600 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.38■■■■■ 4.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.33■■■■■ 4.21
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.31■■■■■ 4.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.3■■■■■ 4.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.27■■■■■ 4.2
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.26■■■■■ 4.2
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRPM2O94759 1503 aa41.24■■■■■ 4.19
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPRTO14522 1441 aa41.23■■■■■ 4.19
CTDNEP1-208ENST00000573600 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.19■■■■■ 4.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP152O94986 1710 aa41.17■■■■■ 4.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.15■■■■■ 4.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.18
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.11■■■■■ 4.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.09■■■■■ 4.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 GGT6Q6P531 493 aa41.07■■■■■ 4.17
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 CLTCL1P53675 1640 aa41.05■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 REREQ9P2R6 1566 aa41.04■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 MIER1Q8N108 512 aa41.04■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.04■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCC3O15438 1527 aa41.03■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.03■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 RGL3Q3MIN7 710 aa41.01■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.01■■■■■ 4.16
CTDNEP1-208ENST00000573600 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.98■■■■■ 4.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.98■■■■■ 4.15
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.97■■■■■ 4.15
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CTDNEP1-208ENST00000573600 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
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CTDNEP1-208ENST00000573600 USP47Q96K76 1375 aa40.88■■■■■ 4.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.87■■■■■ 4.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.86■■■■■ 4.13
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.86■■■■■ 4.13
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.8■■■■■ 4.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.79■■■■■ 4.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.79■■■■■ 4.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.77■■■■■ 4.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 NOS1P29475 1434 aa40.76■■■■■ 4.12
CTDNEP1-208ENST00000573600 MADDQ8WXG6 1647 aa40.75■■■■■ 4.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CCDC7Q96M83 1385 aa40.73■■■■■ 4.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRB3O60242 1522 aa40.71■■■■■ 4.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 IFT172Q9UG01 1749 aa40.68■■■■■ 4.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIK3C2BO00750 1634 aa40.67■■■■■ 4.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 MYOM2P54296 1465 aa40.67■■■■■ 4.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 SYNMO15061 1565 aa40.65■■■■■ 4.1
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.1
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.62■■■■■ 4.09
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.55■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANP32CO43423 234 aa40.55■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.54■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.54■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPLO60437 1756 aa40.53■■■■■ 4.08
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
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