RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573569.5

ARL16-208, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 16, human

TSL 2

Gene ARL16, Length 786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL16-208	ENST00000573569	TSPY4	P0CV99	314 aa		43.3	■■■■■ 4.52
ARL16-208	ENST00000573569	TSPY10	P0CW01	314 aa		43.3	■■■■■ 4.52
ARL16-208	ENST00000573569	KIF3B	O15066	747 aa		43.29	■■■■■ 4.52
ARL16-208	ENST00000573569	PLA2R1	Q13018	1463 aa		43.25	■■■■■ 4.51
ARL16-208	ENST00000573569	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
ARL16-208	ENST00000573569	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.23	■■■■■ 4.51
ARL16-208	ENST00000573569	PZP	P20742	1482 aa		43.21	■■■■■ 4.51
ARL16-208	ENST00000573569	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		43.19	■■■■■ 4.5
ARL16-208	ENST00000573569	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.18	■■■■■ 4.5
ARL16-208	ENST00000573569	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		43.18	■■■■■ 4.5
ARL16-208	ENST00000573569	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.18	■■■■■ 4.5
ARL16-208	ENST00000573569	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.17	■■■■■ 4.5
ARL16-208	ENST00000573569	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.16	■■■■■ 4.5
ARL16-208	ENST00000573569	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.13	■■■■■ 4.49
ARL16-208	ENST00000573569	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.12	■■■■■ 4.49
ARL16-208	ENST00000573569	APLP2	Q06481	763 aa		43.1	■■■■■ 4.49
ARL16-208	ENST00000573569	TNR	Q92752	1358 aa		43.09	■■■■■ 4.49
ARL16-208	ENST00000573569	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	43.08	■■■■■ 4.49
ARL16-208	ENST00000573569	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		43.08	■■■■■ 4.49
ARL16-208	ENST00000573569	PKD2	Q13563	968 aa		43.07	■■■■■ 4.49
ARL16-208	ENST00000573569	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43.07	■■■■■ 4.48
ARL16-208	ENST00000573569	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ARL16-208	ENST00000573569	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.06	■■■■■ 4.48
ARL16-208	ENST00000573569	ABCC3	O15438	1527 aa		43.05	■■■■■ 4.48
ARL16-208	ENST00000573569	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		43.04	■■■■■ 4.48
ARL16-208	ENST00000573569	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	43.03	■■■■■ 4.48
ARL16-208	ENST00000573569	CEP152	O94986	1710 aa		43.02	■■■■■ 4.48
ARL16-208	ENST00000573569	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ARL16-208	ENST00000573569	ABCC5	O15440	1437 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ARL16-208	ENST00000573569	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.97	■■■■■ 4.47
ARL16-208	ENST00000573569	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.94	■■■■■ 4.46
ARL16-208	ENST00000573569	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.93	■■■■■ 4.46
ARL16-208	ENST00000573569	DAPK1	P53355	1430 aa		42.92	■■■■■ 4.46
ARL16-208	ENST00000573569	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
ARL16-208	ENST00000573569	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ARL16-208	ENST00000573569	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ARL16-208	ENST00000573569	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.9	■■■■■ 4.46
ARL16-208	ENST00000573569	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.88	■■■■■ 4.45
ARL16-208	ENST00000573569	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
ARL16-208	ENST00000573569	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.86	■■■■■ 4.45
ARL16-208	ENST00000573569	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.86	■■■■■ 4.45
ARL16-208	ENST00000573569	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.78	■■■■■ 4.44
ARL16-208	ENST00000573569	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.76	■■■■■ 4.44
ARL16-208	ENST00000573569	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.75	■■■■■ 4.43
ARL16-208	ENST00000573569	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ARL16-208	ENST00000573569	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ARL16-208	ENST00000573569	MED14	O60244	1454 aa		42.71	■■■■■ 4.43
ARL16-208	ENST00000573569	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ARL16-208	ENST00000573569	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ARL16-208	ENST00000573569	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ARL16-208	ENST00000573569	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ARL16-208	ENST00000573569	CPS1	P31327	1500 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ARL16-208	ENST00000573569	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.63	■■■■■ 4.42
ARL16-208	ENST00000573569	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.63	■■■■■ 4.41
ARL16-208	ENST00000573569	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ARL16-208	ENST00000573569	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.61	■■■■■ 4.41
ARL16-208	ENST00000573569	KANK1	Q14678	1352 aa		42.59	■■■■■ 4.41
ARL16-208	ENST00000573569	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.55	■■■■■ 4.4
ARL16-208	ENST00000573569	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ARL16-208	ENST00000573569	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.51	■■■■■ 4.4
ARL16-208	ENST00000573569	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
ARL16-208	ENST00000573569	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
ARL16-208	ENST00000573569	SLIT1	O75093	1534 aa		42.5	■■■■■ 4.39
ARL16-208	ENST00000573569	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.49	■■■■■ 4.39
ARL16-208	ENST00000573569	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.49	■■■■■ 4.39
ARL16-208	ENST00000573569	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.47	■■■■■ 4.39
ARL16-208	ENST00000573569	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
ARL16-208	ENST00000573569	SYNM	O15061	1565 aa		42.42	■■■■■ 4.38
ARL16-208	ENST00000573569	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.4	■■■■■ 4.38
ARL16-208	ENST00000573569	NOS1	P29475	1434 aa		42.35	■■■■■ 4.37
ARL16-208	ENST00000573569	TET3	O43151	1660 aa		42.34	■■■■■ 4.37
ARL16-208	ENST00000573569	UNC13B	O14795	1591 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ARL16-208	ENST00000573569	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.33	■■■■■ 4.37
ARL16-208	ENST00000573569	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.31	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	LTK	P29376	864 aa		42.3	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.28	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.27	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.27	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	TOM1	O60784	492 aa		42.26	■■■■■ 4.36
ARL16-208	ENST00000573569	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ARL16-208	ENST00000573569	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.24	■■■■■ 4.35
ARL16-208	ENST00000573569	IDI1	Q13907	227 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ARL16-208	ENST00000573569	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ARL16-208	ENST00000573569	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.23	■■■■■ 4.35
ARL16-208	ENST00000573569	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.2	■■■■■ 4.35
ARL16-208	ENST00000573569	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
ARL16-208	ENST00000573569	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
ARL16-208	ENST00000573569	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.16	■■■■■ 4.34
ARL16-208	ENST00000573569	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.16	■■■■■ 4.34
ARL16-208	ENST00000573569	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ARL16-208	ENST00000573569		E9PCH4	1651 aa		42.14	■■■■■ 4.34
ARL16-208	ENST00000573569	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.06	■■■■■ 4.32
ARL16-208	ENST00000573569	HSPA1L	P34931	641 aa		42.05	■■■■■ 4.32
ARL16-208	ENST00000573569	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.03	■■■■■ 4.32
ARL16-208	ENST00000573569	ZFYVE9	O95405	1425 aa		41.99	■■■■■ 4.31
ARL16-208	ENST00000573569	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
ARL16-208	ENST00000573569	NWD1	Q149M9	1564 aa		41.97	■■■■■ 4.31
ARL16-208	ENST00000573569	ITGAE	P38570	1179 aa		41.95	■■■■■ 4.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms