RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 CREBZFQ9NS37 354 aa9.15□□□□□ -0.94
GINS3-210ENST00000568468 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.15□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 MBD5Q9P267 1494 aa9.15□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 POGZQ7Z3K3 1410 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 SCAPERQ9BY12 1400 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 RICTORQ6R327 1708 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 HAX1O00165 279 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 AFAP1Q8N556 730 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 ABCC1P33527 1531 aa9.14□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
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GINS3-210ENST00000568468 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.12□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 KDM5CP41229 1560 aa9.12□□□□□ -0.95
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GINS3-210ENST00000568468 C9orf84Q5VXU9 1444 aa9.11□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 MAGI2Q86UL8 1455 aa9.1□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 TSPY4P0CV99 314 aa9.1□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 TSPY10P0CW01 314 aa9.1□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.1□□□□□ -0.95
GINS3-210ENST00000568468 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
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GINS3-210ENST00000568468 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.08□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
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GINS3-210ENST00000568468 SHANK2Q9UPX8 1470 aa9.07□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.07□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 CROCC2H7BZ55 1655 aa9.07□□□□□ -0.96
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GINS3-210ENST00000568468 NCOA1Q15788 1441 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 RSPH4AQ5TD94 716 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.06□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 KIF15Q9NS87 1388 aa9.06□□□□□ -0.96
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GINS3-210ENST00000568468 ADGRL2O95490 1459 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 ROCK1Q13464 1354 aa9.05□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 ATP10AO60312 1499 aa9.04□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 MIER1Q8N108 512 aa9.04□□□□□ -0.96
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GINS3-210ENST00000568468 ATP7AQ04656 1500 aa9.04□□□□□ -0.96
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GINS3-210ENST00000568468 ABCA6Q8N139 1617 aa9.03□□□□□ -0.96
GINS3-210ENST00000568468 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
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GINS3-210ENST00000568468 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.02□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.01□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa9.01□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 ADAMTSL3P82987 1691 aa9□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 AGLP35573 1532 aa9□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 PLXNC1O60486 1568 aa9□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9□□□□□ -0.97
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GINS3-210ENST00000568468 A2MP01023 1474 aa8.99□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.99□□□□□ -0.97
GINS3-210ENST00000568468 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
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GINS3-210ENST00000568468 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GINS3-210ENST00000568468 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.91□□□□□ -0.98
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GINS3-210ENST00000568468 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.91□□□□□ -0.98
GINS3-210ENST00000568468 UNC13BO14795 1591 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS3-210ENST00000568468 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS3-210ENST00000568468 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.9□□□□□ -0.98
GINS3-210ENST00000568468 KANK1Q14678 1352 aa8.89□□□□□ -0.99
GINS3-210ENST00000568468 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.89□□□□□ -0.99
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