RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568104.5

BBS2-218, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BBS2, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-218ENST00000568104 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.65■■□□□ 1.22
BBS2-218ENST00000568104 BCANQ96GW7 911 aa22.65■■□□□ 1.22
BBS2-218ENST00000568104 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.213e-6■□□□□ 10.3
BBS2-218ENST00000568104 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.63■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.62■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 ERBINQ96RT1 1412 aa22.62■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.61■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 ABCC1P33527 1531 aa22.6■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 PLA2R1Q13018 1463 aa22.6■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.58■■□□□ 1.21
BBS2-218ENST00000568104 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.57■■□□□ 1.2
BBS2-218ENST00000568104 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.56■■□□□ 1.2
BBS2-218ENST00000568104 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.56■■□□□ 1.2
BBS2-218ENST00000568104 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.54■■□□□ 1.2
BBS2-218ENST00000568104 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.54■■□□□ 1.2
BBS2-218ENST00000568104 RGL3Q3MIN7 710 aa22.53■■□□□ 1.2
BBS2-218ENST00000568104 ATP10AO60312 1499 aa22.53■■□□□ 1.2
BBS2-218ENST00000568104 A2MP01023 1474 aa22.51■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.51■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.5■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.49■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.49■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.47■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 AFAP1Q8N556 730 aa22.45■■□□□ 1.19
BBS2-218ENST00000568104 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.45■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.44■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 LAMC1P11047 1609 aa22.44■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 E9PCH4 1651 aa22.42■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 FANCAO15360 1455 aa22.41■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.41■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
BBS2-218ENST00000568104 RALBP1Q15311 655 aa22.37■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 TMC1Q8TDI8 760 aa22.37■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 ATP7AQ04656 1500 aa22.36■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 DEPDC5O75140 1603 aa22.36■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.36■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 TRPM2O94759 1503 aa22.34■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 ADGRL1O94910 1474 aa22.34■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 ASXL2Q76L83 1435 aa22.33■■□□□ 1.17
BBS2-218ENST00000568104 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 TESK2Q96S53 571 aa22.32■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 PTPRTO14522 1441 aa22.32■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.32■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 KANK1Q14678 1352 aa22.32■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.31■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 TET3O43151 1660 aa22.31■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.29■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.29■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 CEP152O94986 1710 aa22.28■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.28■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 MADDQ8WXG6 1647 aa22.27■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 KIF3BO15066 747 aa22.27■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 TMF1P82094 1093 aa22.27■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 STAC3Q96MF2 364 aa22.27■■□□□ 1.16
BBS2-218ENST00000568104 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.26■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 CLTCL1P53675 1640 aa22.26■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.25■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.24■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 NLRP13Q86W25 1043 aa22.23■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 NUDCQ9Y266 331 aa22.23■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.22■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 OSCARQ8IYS5 282 aa22.22■■□□□ 1.15
BBS2-218ENST00000568104 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.2■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 IQGAP1P46940 1657 aa22.19■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 PANK3Q9H999 370 aa22.19■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.19■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.18■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.18■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
BBS2-218ENST00000568104 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.14■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.13■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.13■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 CD109Q6YHK3 1445 aa22.12■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.12■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.11■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 CDCA8Q53HL2 280 aa22.11■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.1■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.09■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.09■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 MYOM2P54296 1465 aa22.08■■□□□ 1.13
BBS2-218ENST00000568104 KIF1BO60333 1816 aa22.08■■□□□ 1.13
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