RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 APLP2Q06481 763 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-212ENST00000567690 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-212ENST00000567690 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-212ENST00000567690 MIA2Q96PC5 1412 aa11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-212ENST00000567690 PZPP20742 1482 aa11.27□□□□□ -0.6
CCNDBP1-212ENST00000567690 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.27□□□□□ -0.61
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 TNRQ92752 1358 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.26□□□□□ -0.61
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PLA2R1Q13018 1463 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 CEP152O94986 1710 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCC3O15438 1527 aa11.25□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.24□□□□□ -0.61
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 FGD6Q6ZV73 1430 aa11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIF15Q9NS87 1388 aa11.23□□□□□ -0.61
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCC5O15440 1437 aa11.22□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 DAPK1P53355 1430 aa11.22□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.22□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.22□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.21□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 PKD2Q13563 968 aa11.21□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.21□□□□□ -0.61
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.21□□□□□ -0.61
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-7P63135 1459 aa11.19□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.625e-7■■□□□ 12.8
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.19□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLRP1Q9C000 1473 aa11.19□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERBINQ96RT1 1412 aa11.18□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.16□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEPDC5O75140 1603 aa11.16□□□□□ -0.62
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CCNDBP1-212ENST00000567690 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.14□□□□□ -0.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.14□□□□□ -0.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.14□□□□□ -0.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 KANK1Q14678 1352 aa11.14□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-212ENST00000567690 DISP3Q9P2K9 1392 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADGRL2O95490 1459 aa11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPS1P31327 1500 aa11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-212ENST00000567690 MED14O60244 1454 aa11.1□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNMO15061 1565 aa11.09□□□□□ -0.63
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PIP4K2BP78356 416 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGAEP38570 1179 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLIT1O75093 1534 aa11.06□□□□□ -0.64
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 TET3O43151 1660 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ADGRB3O60242 1522 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 UNC13BO14795 1591 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 NOS1P29475 1434 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 EID1Q9Y6B2 187 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALKQ9UM73 1620 aa11.02□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.02□□□□□ -0.64
CCNDBP1-212ENST00000567690 TOM1O60784 492 aa11.02□□□□□ -0.65
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ILDR2Q71H61 639 aa11.02□□□□□ -0.65
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSPA1LP34931 641 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 E9PCH4 1651 aa11□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 BCANQ96GW7 911 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 ROCK1Q13464 1354 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
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