RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566353.5

STX4-216, Transcript of syntaxin 4, human

TSL 2

Gene STX4, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX4-216	ENST00000566353	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.5	■■■□□ 2.95
STX4-216	ENST00000566353	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	33.5	■■■□□ 2.95
STX4-216	ENST00000566353	PKD2	Q13563	968 aa		33.49	■■■□□ 2.95
STX4-216	ENST00000566353	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		33.48	■■■□□ 2.95
STX4-216	ENST00000566353	PZP	P20742	1482 aa		33.47	■■■□□ 2.95
STX4-216	ENST00000566353	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.45	■■■□□ 2.95
STX4-216	ENST00000566353	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		33.44	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	TNR	Q92752	1358 aa		33.43	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	TSPY4	P0CV99	314 aa		33.42	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	TSPY10	P0CW01	314 aa		33.42	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.4	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.39	■■■□□ 2.94
STX4-216	ENST00000566353	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.36	■■■□□ 2.93
STX4-216	ENST00000566353	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.36	■■■□□ 2.93
STX4-216	ENST00000566353	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
STX4-216	ENST00000566353	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
STX4-216	ENST00000566353	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.34	■■■□□ 2.93
STX4-216	ENST00000566353	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.34	■■■□□ 2.93
STX4-216	ENST00000566353	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.31	■■■□□ 2.92
STX4-216	ENST00000566353	ABCC3	O15438	1527 aa		33.3	■■■□□ 2.92
STX4-216	ENST00000566353	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.28	■■■□□ 2.92
STX4-216	ENST00000566353	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.27	■■■□□ 2.92
STX4-216	ENST00000566353	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.26	■■■□□ 2.91
STX4-216	ENST00000566353	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.25	■■■□□ 2.91
STX4-216	ENST00000566353	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.23	■■■□□ 2.91
STX4-216	ENST00000566353	CEP152	O94986	1710 aa		33.22	■■■□□ 2.91
STX4-216	ENST00000566353	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.22	■■■□□ 2.91
STX4-216	ENST00000566353	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.21	■■■□□ 2.91	3e-8	■□□□□ 8.2
STX4-216	ENST00000566353	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.21	■■■□□ 2.91
STX4-216	ENST00000566353	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.2	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.18	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	CPS1	P31327	1500 aa		33.18	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.17	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		33.17	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.16	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	MED14	O60244	1454 aa		33.14	■■■□□ 2.9
STX4-216	ENST00000566353	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.13	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.12	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	ABCC5	O15440	1437 aa		33.11	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	KIF15	Q9NS87	1388 aa		33.1	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.1	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.09	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	APLP2	Q06481	763 aa		33.08	■■■□□ 2.89
STX4-216	ENST00000566353	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.07	■■■□□ 2.88
STX4-216	ENST00000566353	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
STX4-216	ENST00000566353	DAPK1	P53355	1430 aa		33.06	■■■□□ 2.88
STX4-216	ENST00000566353	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.04	■■■□□ 2.88
STX4-216	ENST00000566353	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.02	■■■□□ 2.88
STX4-216	ENST00000566353	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.01	■■■□□ 2.87
STX4-216	ENST00000566353	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		32.97	■■■□□ 2.87
STX4-216	ENST00000566353	TOM1	O60784	492 aa		32.95	■■■□□ 2.87
STX4-216	ENST00000566353	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	SYNM	O15061	1565 aa		32.94	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	PIP4K2B	P78356	416 aa		32.92	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.92	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	SLIT1	O75093	1534 aa		32.92	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		32.91	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.91	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	SOCS7	O14512	581 aa		32.9	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.9	■■■□□ 2.86	4e-7	■■■□□ 15.6
STX4-216	ENST00000566353	KANK1	Q14678	1352 aa		32.9	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	ALK	Q9UM73	1620 aa		32.9	■■■□□ 2.86
STX4-216	ENST00000566353	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.88	■■■□□ 2.85
STX4-216	ENST00000566353	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		32.87	■■■□□ 2.85
STX4-216	ENST00000566353	HSPA1L	P34931	641 aa		32.87	■■■□□ 2.85
STX4-216	ENST00000566353	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		32.87	■■■□□ 2.85
STX4-216	ENST00000566353	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
STX4-216	ENST00000566353	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.83	■■■□□ 2.85
STX4-216	ENST00000566353	LTK	P29376	864 aa		32.81	■■■□□ 2.84
STX4-216	ENST00000566353	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.8	■■■□□ 2.84
STX4-216	ENST00000566353	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.8	■■■□□ 2.84
STX4-216	ENST00000566353	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
STX4-216	ENST00000566353	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.76	■■■□□ 2.83
STX4-216	ENST00000566353	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.76	■■■□□ 2.83
STX4-216	ENST00000566353	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.73	■■■□□ 2.83
STX4-216	ENST00000566353	NOS1	P29475	1434 aa		32.72	■■■□□ 2.83
STX4-216	ENST00000566353	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
STX4-216	ENST00000566353	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
STX4-216	ENST00000566353	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.7	■■■□□ 2.83
STX4-216	ENST00000566353	IDI1	Q13907	227 aa		32.69	■■■□□ 2.82
STX4-216	ENST00000566353	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.68	■■■□□ 2.82
STX4-216	ENST00000566353	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.64	■■■□□ 2.82
STX4-216	ENST00000566353	TET3	O43151	1660 aa		32.63	■■■□□ 2.81
STX4-216	ENST00000566353	UNC13B	O14795	1591 aa		32.59	■■■□□ 2.81
STX4-216	ENST00000566353	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.59	■■■□□ 2.81
STX4-216	ENST00000566353	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
STX4-216	ENST00000566353	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.57	■■■□□ 2.8
STX4-216	ENST00000566353	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.56	■■■□□ 2.8
STX4-216	ENST00000566353	NWD1	Q149M9	1564 aa		32.53	■■■□□ 2.8
STX4-216	ENST00000566353	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		32.52	■■■□□ 2.8
STX4-216	ENST00000566353	TMEM94	Q12767	1356 aa		32.51	■■■□□ 2.79
STX4-216	ENST00000566353	KCNA6	P17658	529 aa		32.51	■■■□□ 2.79
STX4-216	ENST00000566353	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.49	■■■□□ 2.79

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