RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564160.1

ERVK13-1-202, Transcript of endogenous retrovirus group K13 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene ERVK13-1, Length 983 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1-202ENST00000564160 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.74■■■■■ 4.27
ERVK13-1-202ENST00000564160 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.73■■■■■ 4.27
ERVK13-1-202ENST00000564160 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.69■■■■■ 4.27
ERVK13-1-202ENST00000564160 PZPP20742 1482 aa41.69■■■■■ 4.26
ERVK13-1-202ENST00000564160 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.69■■■■■ 4.26
ERVK13-1-202ENST00000564160 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.67■■■■■ 4.26
ERVK13-1-202ENST00000564160 TNRQ92752 1358 aa41.65■■■■■ 4.26
ERVK13-1-202ENST00000564160 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.63■■■■■ 4.26
ERVK13-1-202ENST00000564160 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.6■■■■■ 4.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.59■■■■■ 4.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.59■■■■■ 4.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.58■■■■■ 4.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 TSPY4P0CV99 314 aa41.57■■■■■ 4.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 TSPY10P0CW01 314 aa41.57■■■■■ 4.25
ERVK13-1-202ENST00000564160 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 ILDR2Q71H61 639 aa41.54■■■■■ 4.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 MAP3K1Q13233 1512 aa41.54■■■■■ 4.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.52■■■■■ 4.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 MIA2Q96PC5 1412 aa41.51■■■■■ 4.24
ERVK13-1-202ENST00000564160 NLRP1Q9C000 1473 aa41.47■■■■■ 4.23
ERVK13-1-202ENST00000564160 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.47■■■■■ 4.23
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCC3O15438 1527 aa41.45■■■■■ 4.23
ERVK13-1-202ENST00000564160 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
ERVK13-1-202ENST00000564160 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.44■■■■■ 4.23
ERVK13-1-202ENST00000564160 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
ERVK13-1-202ENST00000564160 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.43■■■■■ 4.22
ERVK13-1-202ENST00000564160 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.43■■■■■ 4.22
ERVK13-1-202ENST00000564160 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.42■■■■■ 4.22
ERVK13-1-202ENST00000564160 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 DEPDC5O75140 1603 aa41.37■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.37■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 CPS1P31327 1500 aa41.36■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.36■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 MED14O60244 1454 aa41.35■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.34■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 CEP152O94986 1710 aa41.32■■■■■ 4.21
ERVK13-1-202ENST00000564160 ERVK-7P63135 1459 aa41.31■■■■■ 4.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.29■■■■■ 4.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 SOCS7O14512 581 aa41.26■■■■■ 4.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.26■■■■■ 4.2
ERVK13-1-202ENST00000564160 IQGAP1P46940 1657 aa41.25■■■■■ 4.19
ERVK13-1-202ENST00000564160 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
ERVK13-1-202ENST00000564160 ABCC5O15440 1437 aa41.2■■■■■ 4.19
ERVK13-1-202ENST00000564160 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.19■■■■■ 4.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.18■■■■■ 4.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 KIF15Q9NS87 1388 aa41.17■■■■■ 4.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.17■■■■■ 4.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 ALKQ9UM73 1620 aa41.14■■■■■ 4.18
ERVK13-1-202ENST00000564160 ERBINQ96RT1 1412 aa41.13■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 TOM1O60784 492 aa41.13■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.11■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 HSPA1LP34931 641 aa41.1■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 PIP4K2BP78356 416 aa41.1■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 DAPK1P53355 1430 aa41.09■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.08■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.08■■■■■ 4.17
ERVK13-1-202ENST00000564160 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.05■■■■■ 4.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.04■■■■■ 4.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 SLIT1O75093 1534 aa41.03■■■■■ 4.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.03■■■■■ 4.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
ERVK13-1-202ENST00000564160 SYNMO15061 1565 aa41■■■■■ 4.15
ERVK13-1-202ENST00000564160 APLP2Q06481 763 aa41■■■■■ 4.15
ERVK13-1-202ENST00000564160 LTKP29376 864 aa40.97■■■■■ 4.15
ERVK13-1-202ENST00000564160 PIK3C2BO00750 1634 aa40.96■■■■■ 4.15
ERVK13-1-202ENST00000564160 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.95■■■■■ 4.15
ERVK13-1-202ENST00000564160 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.14
ERVK13-1-202ENST00000564160 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.92■■■■■ 4.14
ERVK13-1-202ENST00000564160 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.9■■■■■ 4.14
ERVK13-1-202ENST00000564160 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.89■■■■■ 4.14
ERVK13-1-202ENST00000564160 KANK1Q14678 1352 aa40.88■■■■■ 4.14
ERVK13-1-202ENST00000564160 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.88■■■■■ 4.13
ERVK13-1-202ENST00000564160 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
ERVK13-1-202ENST00000564160 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.84■■■■■ 4.13
ERVK13-1-202ENST00000564160 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
ERVK13-1-202ENST00000564160 ADGRL2O95490 1459 aa40.81■■■■■ 4.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 EID1Q9Y6B2 187 aa40.79■■■■■ 4.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.78■■■■■ 4.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 IDI1Q13907 227 aa40.77■■■■■ 4.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 NOS1P29475 1434 aa40.76■■■■■ 4.12
ERVK13-1-202ENST00000564160 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.71■■■■■ 4.11
ERVK13-1-202ENST00000564160 TET3O43151 1660 aa40.69■■■■■ 4.1
ERVK13-1-202ENST00000564160 ADGRB3O60242 1522 aa40.67■■■■■ 4.1
ERVK13-1-202ENST00000564160 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
ERVK13-1-202ENST00000564160 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.62■■■■■ 4.09
ERVK13-1-202ENST00000564160 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
ERVK13-1-202ENST00000564160 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
ERVK13-1-202ENST00000564160 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.57■■■■■ 4.09
ERVK13-1-202ENST00000564160 KCNA6P17658 529 aa40.55■■■■■ 4.08
ERVK13-1-202ENST00000564160 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.55■■■■■ 4.08
ERVK13-1-202ENST00000564160 TMEM94Q12767 1356 aa40.55■■■■■ 4.08
ERVK13-1-202ENST00000564160 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.54■■■■■ 4.08
ERVK13-1-202ENST00000564160 NWD1Q149M9 1564 aa40.52■■■■■ 4.08
ERVK13-1-202ENST00000564160 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.08
ERVK13-1-202ENST00000564160 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.5■■■■■ 4.07
ERVK13-1-202ENST00000564160 UNC13BO14795 1591 aa40.49■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms