RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 C3P01024 1663 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.59■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 ERBINQ96RT1 1412 aa24.58■■□□□ 1.53
RNPS1-208ENST00000563857 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-208ENST00000563857 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-208ENST00000563857 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.56■■□□□ 1.52
RNPS1-208ENST00000563857 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.54■■□□□ 1.52
RNPS1-208ENST00000563857 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.53■■□□□ 1.52
RNPS1-208ENST00000563857 KANK1Q14678 1352 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-208ENST00000563857 NCOA1Q15788 1441 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-208ENST00000563857 ADGRL2O95490 1459 aa24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-208ENST00000563857 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-208ENST00000563857 HSPA2P54652 639 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-208ENST00000563857 PTPRKQ15262 1439 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-208ENST00000563857 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-208ENST00000563857 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-208ENST00000563857 PZPP20742 1482 aa24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-208ENST00000563857 ROCK1Q13464 1354 aa24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-208ENST00000563857 TNRQ92752 1358 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-208ENST00000563857 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-208ENST00000563857 ABCC3O15438 1527 aa24.4■■□□□ 1.5
RNPS1-208ENST00000563857 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
RNPS1-208ENST00000563857 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.36■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.35■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 NLRP1Q9C000 1473 aa24.35■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 ITGAEP38570 1179 aa24.35■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 DEPDC5O75140 1603 aa24.35■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.35■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 PKD2Q13563 968 aa24.34■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.33■■□□□ 1.49
RNPS1-208ENST00000563857 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 PTPRTO14522 1441 aa24.31■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 PLA2R1Q13018 1463 aa24.31■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.3■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.29■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.28■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 ERVK-7P63135 1459 aa24.27■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 CEP152O94986 1710 aa24.27■■□□□ 1.48
RNPS1-208ENST00000563857 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.25■■□□□ 1.47
RNPS1-208ENST00000563857 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.23■■□□□ 1.47
RNPS1-208ENST00000563857 STRCQ7RTU9 1775 aa24.22■■□□□ 1.47
RNPS1-208ENST00000563857 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RNPS1-208ENST00000563857 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.21■■□□□ 1.47
RNPS1-208ENST00000563857 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.19■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.19■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.18■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 NUP155O75694 1391 aa24.17■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 UNC13BO14795 1591 aa24.17■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.17■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
RNPS1-208ENST00000563857 TET3O43151 1660 aa24.14■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 EID1Q9Y6B2 187 aa24.12■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 NOS1P29475 1434 aa24.11■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 CERKQ8TCT0 537 aa24.11■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 HFM1A2PYH4 1435 aa24.1■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.1■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.1■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 NAIPQ13075 1403 aa24.1■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 FBXO41Q8TF61 875 aa24.09■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 IDI1Q13907 227 aa24.08■■□□□ 1.45
RNPS1-208ENST00000563857 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 MED14O60244 1454 aa24.05■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.04■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.04■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 TRIM52Q96A61 297 aa24.03■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.02■■□□□ 1.44
RNPS1-208ENST00000563857 SLIT1O75093 1534 aa24.01■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 SYNMO15061 1565 aa23.99■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 PIK3C2BO00750 1634 aa23.99■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.99■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 E9PCH4 1651 aa23.96■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.96■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 ADGRB3O60242 1522 aa23.96■■□□□ 1.43
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.93■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 IQGAP1P46940 1657 aa23.92■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 LTKP29376 864 aa23.92■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 CPS1P31327 1500 aa23.91■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
RNPS1-208ENST00000563857 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.88■■□□□ 1.41
RNPS1-208ENST00000563857 BCANQ96GW7 911 aa23.88■■□□□ 1.41
RNPS1-208ENST00000563857 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.84■■□□□ 1.41
RNPS1-208ENST00000563857 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118 ms