RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563545.1

CHTF18-214, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-214ENST00000563545 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.12■■■■□ 3.21
CHTF18-214ENST00000563545 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.11■■■■□ 3.21
CHTF18-214ENST00000563545 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.1■■■■□ 3.21
CHTF18-214ENST00000563545 PLA2R1Q13018 1463 aa35.1■■■■□ 3.21
CHTF18-214ENST00000563545 MAST1Q9Y2H9 1570 aa35.1■■■■□ 3.21
CHTF18-214ENST00000563545 MIA2Q96PC5 1412 aa35.08■■■■□ 3.21
CHTF18-214ENST00000563545 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.07■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.06■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 PZPP20742 1482 aa35.05■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 PKD2Q13563 968 aa35.05■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 TNRQ92752 1358 aa35.03■■■■□ 3.2
CHTF18-214ENST00000563545 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CHTF18-214ENST00000563545 APLP2Q06481 763 aa34.98■■■■□ 3.19
CHTF18-214ENST00000563545 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
CHTF18-214ENST00000563545 IQSEC2Q5JU85 1478 aa34.96■■■■□ 3.19
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CHTF18-214ENST00000563545 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC3O15438 1527 aa34.91■■■■□ 3.18
CHTF18-214ENST00000563545 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
CHTF18-214ENST00000563545 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.9■■■■□ 3.18
CHTF18-214ENST00000563545 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.89■■■■□ 3.18
CHTF18-214ENST00000563545 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.88■■■■□ 3.17
CHTF18-214ENST00000563545 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.88■■■■□ 3.17
CHTF18-214ENST00000563545 NLRP1Q9C000 1473 aa34.86■■■■□ 3.17
CHTF18-214ENST00000563545 CEP152O94986 1710 aa34.84■■■■□ 3.17
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC5O15440 1437 aa34.84■■■■□ 3.17
CHTF18-214ENST00000563545 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.84■■■■□ 3.17
CHTF18-214ENST00000563545 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.83■■■■□ 3.17
CHTF18-214ENST00000563545 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.82■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 KIF15Q9NS87 1388 aa34.81■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 FGD6Q6ZV73 1430 aa34.81■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.8■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.8■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 DAPK1P53355 1430 aa34.78■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.77■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 ERVK-7P63135 1459 aa34.77■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.76■■■■□ 3.16
CHTF18-214ENST00000563545 ERBINQ96RT1 1412 aa34.75■■■■□ 3.15
CHTF18-214ENST00000563545 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
CHTF18-214ENST00000563545 DEPDC5O75140 1603 aa34.7■■■■□ 3.15
CHTF18-214ENST00000563545 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.69■■■■□ 3.14
CHTF18-214ENST00000563545 MED14O60244 1454 aa34.66■■■■□ 3.14
CHTF18-214ENST00000563545 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
CHTF18-214ENST00000563545 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.66■■■■□ 3.14
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.64■■■■□ 3.14
CHTF18-214ENST00000563545 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.63■■■■□ 3.13
CHTF18-214ENST00000563545 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.63■■■■□ 3.133e-6■□□□□ 11.3
CHTF18-214ENST00000563545 CPS1P31327 1500 aa34.63■■■■□ 3.13
CHTF18-214ENST00000563545 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.62■■■■□ 3.13
CHTF18-214ENST00000563545 IQGAP1P46940 1657 aa34.62■■■■□ 3.13
CHTF18-214ENST00000563545 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.61■■■■□ 3.13
CHTF18-214ENST00000563545 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.59■■■■□ 3.13
CHTF18-214ENST00000563545 KANK1Q14678 1352 aa34.58■■■■□ 3.13
CHTF18-214ENST00000563545 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CHTF18-214ENST00000563545 ADGRL2O95490 1459 aa34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-214ENST00000563545 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.5■■■■□ 3.11
CHTF18-214ENST00000563545 PIK3C2BO00750 1634 aa34.48■■■■□ 3.11
CHTF18-214ENST00000563545 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-214ENST00000563545 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-214ENST00000563545 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-214ENST00000563545 SLIT1O75093 1534 aa34.46■■■■□ 3.11
CHTF18-214ENST00000563545 TOM1O60784 492 aa34.44■■■■□ 3.1
CHTF18-214ENST00000563545 LTKP29376 864 aa34.43■■■■□ 3.1
CHTF18-214ENST00000563545 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
CHTF18-214ENST00000563545 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.42■■■■□ 3.1
CHTF18-214ENST00000563545 PIP4K2BP78356 416 aa34.41■■■■□ 3.1
CHTF18-214ENST00000563545 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.4■■■■□ 3.1
CHTF18-214ENST00000563545 ILDR2Q71H61 639 aa34.39■■■■□ 3.1
CHTF18-214ENST00000563545 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 SYNMO15061 1565 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 STAG3Q9UJ98 1225 aa34.38■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 EID1Q9Y6B2 187 aa34.37■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.36■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 IDI1Q13907 227 aa34.36■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.35■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 NOS1P29475 1434 aa34.34■■■■□ 3.09
CHTF18-214ENST00000563545 HSPA1LP34931 641 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-214ENST00000563545 ALKQ9UM73 1620 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-214ENST00000563545 TET3O43151 1660 aa34.26■■■■□ 3.08
CHTF18-214ENST00000563545 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.07
CHTF18-214ENST00000563545 ADGRB3O60242 1522 aa34.25■■■■□ 3.07
CHTF18-214ENST00000563545 SLC52A1Q9NWF4 448 aa34.24■■■■□ 3.07
CHTF18-214ENST00000563545 UNC13BO14795 1591 aa34.23■■■■□ 3.07
CHTF18-214ENST00000563545 GCC2Q8IWJ2 1684 aa34.22■■■■□ 3.07
CHTF18-214ENST00000563545 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
CHTF18-214ENST00000563545 ROCK1Q13464 1354 aa34.2■■■■□ 3.07
CHTF18-214ENST00000563545 MYO5BQ9ULV0 1848 aa34.18■■■■□ 3.06
CHTF18-214ENST00000563545 SOCS7O14512 581 aa34.15■■■■□ 3.06
CHTF18-214ENST00000563545 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
CHTF18-214ENST00000563545 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.12■■■■□ 3.05
CHTF18-214ENST00000563545 ITGAEP38570 1179 aa34.11■■■■□ 3.05
CHTF18-214ENST00000563545 E9PCH4 1651 aa34.11■■■■□ 3.05
CHTF18-214ENST00000563545 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CHTF18-214ENST00000563545 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.09■■■■□ 3.05
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