RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 PKD2Q13563 968 aa22.82■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.81■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.79■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 TNRQ92752 1358 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 ILDR2Q71H61 639 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 PZPP20742 1482 aa22.78■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.77■■□□□ 1.24
CTU2-203ENST00000562011 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 TSPY4P0CV99 314 aa22.75■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 TSPY10P0CW01 314 aa22.75■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.75■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU2-203ENST00000562011 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 MIA2Q96PC5 1412 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 ABCC3O15438 1527 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 MAP3K1Q13233 1512 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.66■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 CEP152O94986 1710 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 NLRP1Q9C000 1473 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
CTU2-203ENST00000562011 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.62■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.62■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.61■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 ERVK-7P63135 1459 aa22.6■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 DEPDC5O75140 1603 aa22.59■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
CTU2-203ENST00000562011 MED14O60244 1454 aa22.58■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.58■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 CPS1P31327 1500 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.57■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 IQGAP1P46940 1657 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 ABCC5O15440 1437 aa22.56■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 PIP4K2BP78356 416 aa22.55■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 SOCS7O14512 581 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.54■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 KIF15Q9NS87 1388 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.53■■□□□ 1.2
CTU2-203ENST00000562011 ALKQ9UM73 1620 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 HSPA1LP34931 641 aa22.51■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 DAPK1P53355 1430 aa22.48■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 TOM1O60784 492 aa22.48■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.47■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 ERBINQ96RT1 1412 aa22.47■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 APLP2Q06481 763 aa22.46■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.46■■□□□ 1.19
CTU2-203ENST00000562011 LTKP29376 864 aa22.45■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.45■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.45■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 PIK3C2BO00750 1634 aa22.43■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.42■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 SLIT1O75093 1534 aa22.41■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.4■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CTU2-203ENST00000562011 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 SYNMO15061 1565 aa22.38■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.37■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 KANK1Q14678 1352 aa22.36■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.34■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 IDI1Q13907 227 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.33■■□□□ 1.17
CTU2-203ENST00000562011 EID1Q9Y6B2 187 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-203ENST00000562011 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-203ENST00000562011 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-203ENST00000562011 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-203ENST00000562011 ADGRL2O95490 1459 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-203ENST00000562011 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-203ENST00000562011 NOS1P29475 1434 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-203ENST00000562011 TET3O43151 1660 aa22.25■■□□□ 1.15
CTU2-203ENST00000562011 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-203ENST00000562011 ADGRB3O60242 1522 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-203ENST00000562011 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.24■■□□□ 1.15
CTU2-203ENST00000562011 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.23■■□□□ 1.15
CTU2-203ENST00000562011 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CTU2-203ENST00000562011 TMEM94Q12767 1356 aa22.2■■□□□ 1.14
CTU2-203ENST00000562011 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-203ENST00000562011 KCNA6P17658 529 aa22.18■■□□□ 1.14
CTU2-203ENST00000562011 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTU2-203ENST00000562011 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.16■■□□□ 1.14
CTU2-203ENST00000562011 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTU2-203ENST00000562011 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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