RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561187.1

SNRPA1-215, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A', human

TSL 2

Gene SNRPA1, Length 509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNRPA1-215	ENST00000561187	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SNRPA1-215	ENST00000561187	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		42.7	■■■■■ 4.43
SNRPA1-215	ENST00000561187	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
SNRPA1-215	ENST00000561187	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		42.67	■■■■■ 4.42
SNRPA1-215	ENST00000561187	PLA2R1	Q13018	1463 aa		42.65	■■■■■ 4.42
SNRPA1-215	ENST00000561187	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SNRPA1-215	ENST00000561187	PZP	P20742	1482 aa		42.63	■■■■■ 4.42
SNRPA1-215	ENST00000561187	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SNRPA1-215	ENST00000561187	TNR	Q92752	1358 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SNRPA1-215	ENST00000561187	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	42.61	■■■■■ 4.41
SNRPA1-215	ENST00000561187	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
SNRPA1-215	ENST00000561187	MIA2	Q96PC5	1412 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SNRPA1-215	ENST00000561187	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SNRPA1-215	ENST00000561187	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.58	■■■■■ 4.41
SNRPA1-215	ENST00000561187	PKD2	Q13563	968 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SNRPA1-215	ENST00000561187	APLP2	Q06481	763 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SNRPA1-215	ENST00000561187	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
SNRPA1-215	ENST00000561187	ABCC3	O15438	1527 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SNRPA1-215	ENST00000561187	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SNRPA1-215	ENST00000561187	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	42.47	■■■■■ 4.39
SNRPA1-215	ENST00000561187	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.44	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		42.43	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	CEP152	O94986	1710 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		42.4	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	42.39	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	ABCC5	O15440	1437 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SNRPA1-215	ENST00000561187	KIF15	Q9NS87	1388 aa		42.38	■■■■■ 4.37
SNRPA1-215	ENST00000561187	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SNRPA1-215	ENST00000561187	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		42.36	■■■■■ 4.37
SNRPA1-215	ENST00000561187	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		42.35	■■■■■ 4.37
SNRPA1-215	ENST00000561187	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SNRPA1-215	ENST00000561187	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SNRPA1-215	ENST00000561187	DAPK1	P53355	1430 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SNRPA1-215	ENST00000561187	ERVK-7	P63135	1459 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SNRPA1-215	ENST00000561187	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		42.31	■■■■■ 4.36
SNRPA1-215	ENST00000561187	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	42.3	■■■■■ 4.36
SNRPA1-215	ENST00000561187	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SNRPA1-215	ENST00000561187	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SNRPA1-215	ENST00000561187	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
SNRPA1-215	ENST00000561187	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.25	■■■■■ 4.35
SNRPA1-215	ENST00000561187	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SNRPA1-215	ENST00000561187	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.23	■■■■■ 4.35	2e-7	■□□□□ 8
SNRPA1-215	ENST00000561187	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.23	■■■■■ 4.35
SNRPA1-215	ENST00000561187	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SNRPA1-215	ENST00000561187	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
SNRPA1-215	ENST00000561187	DEPDC5	O75140	1603 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SNRPA1-215	ENST00000561187	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.12	■■■■■ 4.33
SNRPA1-215	ENST00000561187	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.11	■■■■■ 4.33
SNRPA1-215	ENST00000561187	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.11	■■■■■ 4.33
SNRPA1-215	ENST00000561187	CPS1	P31327	1500 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SNRPA1-215	ENST00000561187	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SNRPA1-215	ENST00000561187	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
SNRPA1-215	ENST00000561187	MED14	O60244	1454 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SNRPA1-215	ENST00000561187	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
SNRPA1-215	ENST00000561187	KANK1	Q14678	1352 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SNRPA1-215	ENST00000561187	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.03	■■■■■ 4.32
SNRPA1-215	ENST00000561187	PIP4K2B	P78356	416 aa		41.99	■■■■■ 4.31
SNRPA1-215	ENST00000561187	PIK3C2B	O00750	1634 aa		41.96	■■■■■ 4.31
SNRPA1-215	ENST00000561187	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
SNRPA1-215	ENST00000561187	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SNRPA1-215	ENST00000561187	ILDR2	Q71H61	639 aa		41.94	■■■■■ 4.3
SNRPA1-215	ENST00000561187	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		41.93	■■■■■ 4.3
SNRPA1-215	ENST00000561187	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		41.9	■■■■■ 4.3
SNRPA1-215	ENST00000561187	LTK	P29376	864 aa		41.9	■■■■■ 4.3
SNRPA1-215	ENST00000561187	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	SLIT1	O75093	1534 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	TOM1	O60784	492 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	SYNM	O15061	1565 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41.82	■■■■■ 4.29
SNRPA1-215	ENST00000561187	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SNRPA1-215	ENST00000561187	HSPA1L	P34931	641 aa		41.81	■■■■■ 4.28
SNRPA1-215	ENST00000561187	EID1	Q9Y6B2	187 aa		41.79	■■■■■ 4.28
SNRPA1-215	ENST00000561187	IDI1	Q13907	227 aa		41.78	■■■■■ 4.28
SNRPA1-215	ENST00000561187	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SNRPA1-215	ENST00000561187	ALK	Q9UM73	1620 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SNRPA1-215	ENST00000561187	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.76	■■■■■ 4.28
SNRPA1-215	ENST00000561187	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	41.75	■■■■■ 4.27
SNRPA1-215	ENST00000561187	NOS1	P29475	1434 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SNRPA1-215	ENST00000561187	ADGRB3	O60242	1522 aa		41.7	■■■■■ 4.27
SNRPA1-215	ENST00000561187	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	41.67	■■■■■ 4.26
SNRPA1-215	ENST00000561187	ITGAE	P38570	1179 aa		41.65	■■■■■ 4.26
SNRPA1-215	ENST00000561187	TET3	O43151	1660 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SNRPA1-215	ENST00000561187	UNC13B	O14795	1591 aa		41.62	■■■■■ 4.25
SNRPA1-215	ENST00000561187	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25
SNRPA1-215	ENST00000561187	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		41.58	■■■■■ 4.25
SNRPA1-215	ENST00000561187	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	41.57	■■■■■ 4.24
SNRPA1-215	ENST00000561187	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		41.56	■■■■■ 4.24
SNRPA1-215	ENST00000561187	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	41.56	■■■■■ 4.24
SNRPA1-215	ENST00000561187	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		41.56	■■■■■ 4.24
SNRPA1-215	ENST00000561187	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		41.55	■■■■■ 4.24
SNRPA1-215	ENST00000561187	SOCS7	O14512	581 aa		41.53	■■■■■ 4.24
SNRPA1-215	ENST00000561187	BCAN	Q96GW7	911 aa		41.53	■■■■■ 4.24
SNRPA1-215	ENST00000561187	ROCK1	Q13464	1354 aa		41.52	■■■■■ 4.24

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