RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560622.5

USP3-AS1-207, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 508 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-207ENST00000560622 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.97■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.96■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.95■■□□□ 1.75
USP3-AS1-207ENST00000560622 PZPP20742 1482 aa25.95■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.93■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.91■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 MAP3K1Q13233 1512 aa25.9■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF3BO15066 747 aa25.9■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 PKD2Q13563 968 aa25.89■■□□□ 1.74
USP3-AS1-207ENST00000560622 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
USP3-AS1-207ENST00000560622 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.88■■□□□ 1.73
USP3-AS1-207ENST00000560622 TNRQ92752 1358 aa25.86■■□□□ 1.73
USP3-AS1-207ENST00000560622 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCC3O15438 1527 aa25.83■■□□□ 1.73
USP3-AS1-207ENST00000560622 CEP152O94986 1710 aa25.83■■□□□ 1.73
USP3-AS1-207ENST00000560622 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.82■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.81■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 ILDR2Q71H61 639 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 MIA2Q96PC5 1412 aa25.8■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 DEPDC5O75140 1603 aa25.79■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.78■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 NLRP1Q9C000 1473 aa25.77■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.77■■□□□ 1.72
USP3-AS1-207ENST00000560622 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.76■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.75■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 MED14O60244 1454 aa25.74■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 TSPY4P0CV99 314 aa25.74■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 TSPY10P0CW01 314 aa25.74■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERVK-7P63135 1459 aa25.72■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.72■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 ALKQ9UM73 1620 aa25.72■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 IQGAP1P46940 1657 aa25.71■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.71■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.71■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.7■■□□□ 1.71
USP3-AS1-207ENST00000560622 CPS1P31327 1500 aa25.69■■□□□ 1.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.68■■□□□ 1.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 ABCC5O15440 1437 aa25.68■■□□□ 1.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
USP3-AS1-207ENST00000560622 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.62■■□□□ 1.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 KIF15Q9NS87 1388 aa25.6■■□□□ 1.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 DAPK1P53355 1430 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 ERBINQ96RT1 1412 aa25.59■■□□□ 1.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
USP3-AS1-207ENST00000560622 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.57■■□□□ 1.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.57■■□□□ 1.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 SLIT1O75093 1534 aa25.56■■□□□ 1.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 PIK3C2BO00750 1634 aa25.55■■□□□ 1.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 SYNMO15061 1565 aa25.54■■□□□ 1.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 SOCS7O14512 581 aa25.53■■□□□ 1.68
USP3-AS1-207ENST00000560622 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-207ENST00000560622 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.51■■□□□ 1.67
USP3-AS1-207ENST00000560622 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-207ENST00000560622 HSPA1LP34931 641 aa25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
USP3-AS1-207ENST00000560622 LTKP29376 864 aa25.48■■□□□ 1.67
USP3-AS1-207ENST00000560622 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USP3-AS1-207ENST00000560622 PIP4K2BP78356 416 aa25.45■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADGRL2O95490 1459 aa25.45■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 TOM1O60784 492 aa25.43■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.42■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 NOS1P29475 1434 aa25.39■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.39■■□□□ 1.66
USP3-AS1-207ENST00000560622 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.39■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 TET3O43151 1660 aa25.39■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.37■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.35■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 ADGRB3O60242 1522 aa25.34■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 APLP2Q06481 763 aa25.34■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 IDI1Q13907 227 aa25.34■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 KANK1Q14678 1352 aa25.33■■□□□ 1.65
USP3-AS1-207ENST00000560622 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-207ENST00000560622 UNC13BO14795 1591 aa25.29■■□□□ 1.64
USP3-AS1-207ENST00000560622 NWD1Q149M9 1564 aa25.27■■□□□ 1.64
USP3-AS1-207ENST00000560622 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.26■■□□□ 1.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 E9PCH4 1651 aa25.25■■□□□ 1.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 ZFYVE9O95405 1425 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 EID1Q9Y6B2 187 aa25.23■■□□□ 1.63
USP3-AS1-207ENST00000560622 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.19■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 TMEM94Q12767 1356 aa25.18■■□□□ 1.62
USP3-AS1-207ENST00000560622 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.18■■□□□ 1.62
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