RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558921.1

KLF13-206, Transcript of Kruppel like factor 13, human

TSL 3

Gene KLF13, Length 440 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLF13-206	ENST00000558921	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		40.96	■■■■■ 4.15
KLF13-206	ENST00000558921	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		40.94	■■■■■ 4.14
KLF13-206	ENST00000558921	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
KLF13-206	ENST00000558921	PTPRK	Q15262	1439 aa		40.92	■■■■■ 4.14
KLF13-206	ENST00000558921	KIF15	Q9NS87	1388 aa		40.9	■■■■■ 4.14
KLF13-206	ENST00000558921	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.9	■■■■■ 4.14
KLF13-206	ENST00000558921	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.85	■■■■■ 4.13
KLF13-206	ENST00000558921	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.84	■■■■■ 4.13
KLF13-206	ENST00000558921	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
KLF13-206	ENST00000558921	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.82	■■■■■ 4.13
KLF13-206	ENST00000558921	PZP	P20742	1482 aa		40.8	■■■■■ 4.12
KLF13-206	ENST00000558921	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
KLF13-206	ENST00000558921	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.77	■■■■■ 4.12
KLF13-206	ENST00000558921	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.76	■■■■■ 4.12
KLF13-206	ENST00000558921	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.76	■■■■■ 4.12
KLF13-206	ENST00000558921	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.76	■■■■■ 4.11
KLF13-206	ENST00000558921	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.75	■■■■■ 4.11
KLF13-206	ENST00000558921	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.75	■■■■■ 4.11
KLF13-206	ENST00000558921	ABCC3	O15438	1527 aa		40.74	■■■■■ 4.11
KLF13-206	ENST00000558921	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.73	■■■■■ 4.11
KLF13-206	ENST00000558921	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.71	■■■■■ 4.11
KLF13-206	ENST00000558921	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
KLF13-206	ENST00000558921	TNR	Q92752	1358 aa		40.68	■■■■■ 4.1
KLF13-206	ENST00000558921	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
KLF13-206	ENST00000558921	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.66	■■■■■ 4.1
KLF13-206	ENST00000558921	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.64	■■■■■ 4.1
KLF13-206	ENST00000558921	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.64	■■■■■ 4.1
KLF13-206	ENST00000558921	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.63	■■■■■ 4.1
KLF13-206	ENST00000558921	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
KLF13-206	ENST00000558921	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.63	■■■■■ 4.09
KLF13-206	ENST00000558921	CEP152	O94986	1710 aa		40.6	■■■■■ 4.09
KLF13-206	ENST00000558921	KANK1	Q14678	1352 aa		40.6	■■■■■ 4.09
KLF13-206	ENST00000558921	PTPRT	O14522	1441 aa		40.59	■■■■■ 4.09
KLF13-206	ENST00000558921	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.59	■■■■■ 4.09
KLF13-206	ENST00000558921	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.56	■■■■■ 4.08
KLF13-206	ENST00000558921	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.54	■■■■■ 4.08
KLF13-206	ENST00000558921	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.54	■■■■■ 4.08
KLF13-206	ENST00000558921	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.53	■■■■■ 4.08
KLF13-206	ENST00000558921	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.53	■■■■■ 4.08
KLF13-206	ENST00000558921	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.52	■■■■■ 4.08
KLF13-206	ENST00000558921	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.51	■■■■■ 4.07
KLF13-206	ENST00000558921	PKD2	Q13563	968 aa		40.5	■■■■■ 4.07
KLF13-206	ENST00000558921	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.48	■■■■■ 4.07
KLF13-206	ENST00000558921	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.47	■■■■■ 4.07
KLF13-206	ENST00000558921	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
KLF13-206	ENST00000558921	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.42	■■■■■ 4.06
KLF13-206	ENST00000558921	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.42	■■■■■ 4.06
KLF13-206	ENST00000558921	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.41	■■■■■ 4.06
KLF13-206	ENST00000558921	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.4	■■■■■ 4.06
KLF13-206	ENST00000558921	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.38	■■■■■ 4.05
KLF13-206	ENST00000558921	ITGAE	P38570	1179 aa		40.36	■■■■■ 4.05
KLF13-206	ENST00000558921	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.36	■■■■■ 4.05
KLF13-206	ENST00000558921	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.34	■■■■■ 4.05
KLF13-206	ENST00000558921	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.31	■■■■■ 4.04
KLF13-206	ENST00000558921	UNC13B	O14795	1591 aa		40.3	■■■■■ 4.04
KLF13-206	ENST00000558921	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.28	■■■■■ 4.04
KLF13-206	ENST00000558921	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.28	■■■■■ 4.04
KLF13-206	ENST00000558921	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
KLF13-206	ENST00000558921	TET3	O43151	1660 aa		40.22	■■■■■ 4.03
KLF13-206	ENST00000558921	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.21	■■■■■ 4.03
KLF13-206	ENST00000558921	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.2	■■■■■ 4.03
KLF13-206	ENST00000558921	NOS1	P29475	1434 aa		40.2	■■■■■ 4.03
KLF13-206	ENST00000558921	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.19	■■■■■ 4.02
KLF13-206	ENST00000558921	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.16	■■■■■ 4.02
KLF13-206	ENST00000558921	MED14	O60244	1454 aa		40.16	■■■■■ 4.02
KLF13-206	ENST00000558921	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.13	■■■■■ 4.02
KLF13-206	ENST00000558921	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	SYNM	O15061	1565 aa		40.12	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.12	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.11	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.1	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	NUP155	O75694	1391 aa		40.1	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	IDI1	Q13907	227 aa		40.09	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	SLIT1	O75093	1534 aa		40.09	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.09	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.08	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.08	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.07	■■■■■ 4.01
KLF13-206	ENST00000558921	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.03	■■■■■ 4
KLF13-206	ENST00000558921	NAIP	Q13075	1403 aa		40.03	■■■■■ 4
KLF13-206	ENST00000558921	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.02	■■■■■ 4
KLF13-206	ENST00000558921		E9PCH4	1651 aa		40.01	■■■■■ 4
KLF13-206	ENST00000558921	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40	■■■■□ 3.99
KLF13-206	ENST00000558921	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		39.99	■■■■□ 3.99
KLF13-206	ENST00000558921	ADGRB3	O60242	1522 aa		39.98	■■■■□ 3.99
KLF13-206	ENST00000558921	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		39.98	■■■■□ 3.99
KLF13-206	ENST00000558921	HFM1	A2PYH4	1435 aa		39.97	■■■■□ 3.99
KLF13-206	ENST00000558921	LTK	P29376	864 aa		39.94	■■■■□ 3.98
KLF13-206	ENST00000558921	CPS1	P31327	1500 aa		39.91	■■■■□ 3.98
KLF13-206	ENST00000558921	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		39.81	■■■■□ 3.96
KLF13-206	ENST00000558921	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	39.79	■■■■□ 3.96
KLF13-206	ENST00000558921	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		39.75	■■■■□ 3.95
KLF13-206	ENST00000558921	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		39.75	■■■■□ 3.95
KLF13-206	ENST00000558921	TRIM52	Q96A61	297 aa		39.74	■■■■□ 3.95
KLF13-206	ENST00000558921	ZFYVE9	O95405	1425 aa		39.74	■■■■□ 3.95
KLF13-206	ENST00000558921	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	39.72	■■■■□ 3.95
KLF13-206	ENST00000558921	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		39.71	■■■■□ 3.95
KLF13-206	ENST00000558921	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	39.69	■■■■□ 3.94
KLF13-206	ENST00000558921	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		39.67	■■■■□ 3.94
KLF13-206	ENST00000558921	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		39.66	■■■■□ 3.94

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