RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 RALBP1Q15311 655 aa27.73■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 E9PCH4 1651 aa27.72■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 FBLN2P98095 1184 aa27.72■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 JPH4Q96JJ6 628 aa27.72■■■□□ 2.03
RPS6KL1-216ENST00000557413 PTPRGP23470 1445 aa27.69■■■□□ 2.02
RPS6KL1-216ENST00000557413 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCA8O94911 1581 aa27.67■■■□□ 2.02
RPS6KL1-216ENST00000557413 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP10BO94823 1461 aa27.66■■■□□ 2.02
RPS6KL1-216ENST00000557413 NUP160Q12769 1436 aa27.65■■■□□ 2.02
RPS6KL1-216ENST00000557413 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP27.63■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.62■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 DEKP35659 375 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 NBR1Q14596 966 aa27.59■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.59■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 NLRP13Q86W25 1043 aa27.59■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.58■■■□□ 2.01
RPS6KL1-216ENST00000557413 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.58■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.57■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.56■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.55■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.54■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.54■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDE3BQ13370 1112 aa27.52■■■□□ 2
RPS6KL1-216ENST00000557413 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa27.51■■□□□ 1.99
RPS6KL1-216ENST00000557413 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.49■■□□□ 1.99
RPS6KL1-216ENST00000557413 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.48■■□□□ 1.99
RPS6KL1-216ENST00000557413 RGL3Q3MIN7 710 aa27.48■■□□□ 1.99
RPS6KL1-216ENST00000557413 PREX2Q70Z35 1606 aa27.47■■□□□ 1.99
RPS6KL1-216ENST00000557413 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.45■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 RSPH4AQ5TD94 716 aa27.45■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 A2MP01023 1474 aa27.43■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.42■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 LAMC1P11047 1609 aa27.42■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.42■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLA2R1Q13018 1463 aa27.41■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 UNC13BO14795 1591 aa27.41■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.4■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 TESK2Q96S53 571 aa27.39■■□□□ 1.98
RPS6KL1-216ENST00000557413 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.38■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.38■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDE4AP27815 886 aa27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 INSRP06213 1382 aa27.37■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 PANK3Q9H999 370 aa27.36■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.36■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.35■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 ERBINQ96RT1 1412 aa27.35■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 MS4A1P11836 297 aa27.34■■□□□ 1.97
RPS6KL1-216ENST00000557413 BACH2Q9BYV9 841 aa27.32■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.32■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLIN1O60240 522 aa27.31■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.31■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMF1P82094 1093 aa27.31■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.29■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.28■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLXNC1O60486 1568 aa27.27■■□□□ 1.96
RPS6KL1-216ENST00000557413 CRBNQ96SW2 442 aa27.25■■□□□ 1.95
RPS6KL1-216ENST00000557413 ATP10AO60312 1499 aa27.24■■□□□ 1.95
RPS6KL1-216ENST00000557413 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
RPS6KL1-216ENST00000557413 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
RPS6KL1-216ENST00000557413 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.2■■□□□ 1.95
RPS6KL1-216ENST00000557413 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.19■■□□□ 1.94
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.18■■□□□ 1.94
RPS6KL1-216ENST00000557413 SKAP1Q86WV1 359 aa27.15■■□□□ 1.94
RPS6KL1-216ENST00000557413 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
RPS6KL1-216ENST00000557413 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.15■■□□□ 1.94
RPS6KL1-216ENST00000557413 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.14■■□□□ 1.94
RPS6KL1-216ENST00000557413 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.14■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 PPP2R1AP30153 589 aa27.11■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 NEFMP07197 916 aa27.1■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP35Q9P2H5 1018 aa27.1■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.1■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 MADDQ8WXG6 1647 aa27.09■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 IQGAP1P46940 1657 aa27.09■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.08■■□□□ 1.93
RPS6KL1-216ENST00000557413 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.07■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.07■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 SYNMO15061 1565 aa27.05■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF521Q96K83 1311 aa27.04■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 GOLGA2Q08379 1002 aa27.03■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDCA8Q53HL2 280 aa27.03■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
RPS6KL1-216ENST00000557413 ABCC2Q92887 1545 aa27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms