RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555574.1

TMX1-202, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMX1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX1-202ENST00000555574 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.98■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 MAP3K1Q13233 1512 aa26.97■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 PZPP20742 1482 aa26.96■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.95■■□□□ 1.91
TMX1-202ENST00000555574 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.95■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 PKD2Q13563 968 aa26.94■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 TSPY4P0CV99 314 aa26.93■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 TSPY10P0CW01 314 aa26.93■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 TNRQ92752 1358 aa26.93■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.91■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.91■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
TMX1-202ENST00000555574 MIA2Q96PC5 1412 aa26.88■■□□□ 1.89
TMX1-202ENST00000555574 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
TMX1-202ENST00000555574 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
TMX1-202ENST00000555574 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.85■■□□□ 1.89
TMX1-202ENST00000555574 ABCC3O15438 1527 aa26.84■■□□□ 1.89
TMX1-202ENST00000555574 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.83■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.82■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 NLRP1Q9C000 1473 aa26.81■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 CEP152O94986 1710 aa26.8■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.79■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.77■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.77■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.77■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
TMX1-202ENST00000555574 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.74■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.74■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 ERVK-7P63135 1459 aa26.73■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 DEPDC5O75140 1603 aa26.72■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.72■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 ABCC5O15440 1437 aa26.71■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 KIF15Q9NS87 1388 aa26.71■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
TMX1-202ENST00000555574 APLP2Q06481 763 aa26.7■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.69■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 CPS1P31327 1500 aa26.69■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 IQGAP1P46940 1657 aa26.68■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.67■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 DAPK1P53355 1430 aa26.67■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.67■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 ERBINQ96RT1 1412 aa26.67■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 MED14O60244 1454 aa26.67■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.65■■□□□ 1.86
TMX1-202ENST00000555574 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.63■■□□□ 1.85
TMX1-202ENST00000555574 ILDR2Q71H61 639 aa26.6■■□□□ 1.85
TMX1-202ENST00000555574 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.59■■□□□ 1.85
TMX1-202ENST00000555574 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.57■■□□□ 1.84
TMX1-202ENST00000555574 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.842e-7■■□□□ 13.6
TMX1-202ENST00000555574 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.54■■□□□ 1.84
TMX1-202ENST00000555574 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.53■■□□□ 1.84
TMX1-202ENST00000555574 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
TMX1-202ENST00000555574 PIK3C2BO00750 1634 aa26.52■■□□□ 1.84
TMX1-202ENST00000555574 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
TMX1-202ENST00000555574 SYNMO15061 1565 aa26.51■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 SLIT1O75093 1534 aa26.51■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 KANK1Q14678 1352 aa26.51■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 PIP4K2BP78356 416 aa26.51■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.5■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 TOM1O60784 492 aa26.49■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 ALKQ9UM73 1620 aa26.49■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.49■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 ADGRL2O95490 1459 aa26.47■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.46■■□□□ 1.83
TMX1-202ENST00000555574 HSPA1LP34931 641 aa26.45■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.44■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 LTKP29376 864 aa26.43■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.42■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 SOCS7O14512 581 aa26.41■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.39■■□□□ 1.82
TMX1-202ENST00000555574 EID1Q9Y6B2 187 aa26.38■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.37■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 NOS1P29475 1434 aa26.36■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 ADGRB3O60242 1522 aa26.35■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 IDI1Q13907 227 aa26.35■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.35■■□□□ 1.81
TMX1-202ENST00000555574 TET3O43151 1660 aa26.31■■□□□ 1.8
TMX1-202ENST00000555574 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
TMX1-202ENST00000555574 UNC13BO14795 1591 aa26.29■■□□□ 1.8
TMX1-202ENST00000555574 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.28■■□□□ 1.8
TMX1-202ENST00000555574 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.28■■□□□ 1.8
TMX1-202ENST00000555574 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
TMX1-202ENST00000555574 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.24■■□□□ 1.79
TMX1-202ENST00000555574 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.21■■□□□ 1.79
TMX1-202ENST00000555574 E9PCH4 1651 aa26.2■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 NWD1Q149M9 1564 aa26.2■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.19■■□□□ 1.78
TMX1-202ENST00000555574 TMEM94Q12767 1356 aa26.19■■□□□ 1.78
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