RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 RGL3Q3MIN7 710 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 CFAP44Q96MT7 982 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 FAM193AP78312 1265 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.05□□□□□ -1.12
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PTPRB-210ENST00000551525 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 MYH16Q9H6N6 1097 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 NESP48681 1621 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.02□□□□□ -1.12
PTPRB-210ENST00000551525 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.02□□□□□ -1.12
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PTPRB-210ENST00000551525 CUX1P39880 1505 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6L22H0YM25 854 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.99□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM132AQ24JP5 1023 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 TICAM2Q86XR7 235 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 CUL7Q14999 1698 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF592Q92610 1267 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 AKNAQ7Z591 1439 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 CNPY4Q8N129 248 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A1P11836 297 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
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PTPRB-210ENST00000551525 PSME1Q06323 249 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 PKD2Q13563 968 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRB-210ENST00000551525 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 IL27Q8NEV9 243 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 TSPYL1Q9H0U9 437 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRB-210ENST00000551525 TOP2BQ02880 1626 aa7.95□□□□□ -1.14
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC144AA2RUR9 1427 aa7.93□□□□□ -1.14
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PTPRB-210ENST00000551525 CD109Q6YHK3 1445 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 GPATCH11Q8N954 259 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 STK26Q9P289 416 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRB-210ENST00000551525 SLC52A1Q9NWF4 448 aa7.92□□□□□ -1.14
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