RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550446.5

LETMD1-224, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 562 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-224	ENST00000550446	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		29.89	■■■□□ 2.38
LETMD1-224	ENST00000550446	TNR	Q92752	1358 aa		29.88	■■■□□ 2.37
LETMD1-224	ENST00000550446	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.87	■■■□□ 2.37
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29.86	■■■□□ 2.37
LETMD1-224	ENST00000550446	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.85	■■■□□ 2.37
LETMD1-224	ENST00000550446	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
LETMD1-224	ENST00000550446	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.82	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.82	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	APLP2	Q06481	763 aa		29.81	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	MAP3K1	Q13233	1512 aa		29.81	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	PZP	P20742	1482 aa		29.8	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.79	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.78	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		29.77	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	29.77	■■■□□ 2.36
LETMD1-224	ENST00000550446	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.76	■■■□□ 2.35
LETMD1-224	ENST00000550446	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.75	■■■□□ 2.35
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.74	■■■□□ 2.35
LETMD1-224	ENST00000550446	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.73	■■■□□ 2.35
LETMD1-224	ENST00000550446	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		29.73	■■■□□ 2.35
LETMD1-224	ENST00000550446	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.69	■■■□□ 2.34
LETMD1-224	ENST00000550446	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.69	■■■□□ 2.34
LETMD1-224	ENST00000550446	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.67	■■■□□ 2.34
LETMD1-224	ENST00000550446	ABCC3	O15438	1527 aa		29.64	■■■□□ 2.34
LETMD1-224	ENST00000550446	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.62	■■■□□ 2.33
LETMD1-224	ENST00000550446	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.62	■■■□□ 2.33	3e-14	■□□□□ 10.9
LETMD1-224	ENST00000550446	ABCC5	O15440	1437 aa		29.62	■■■□□ 2.33
LETMD1-224	ENST00000550446	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.61	■■■□□ 2.33
LETMD1-224	ENST00000550446	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.61	■■■□□ 2.33
LETMD1-224	ENST00000550446	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.6	■■■□□ 2.33
LETMD1-224	ENST00000550446	ILDR2	Q71H61	639 aa		29.59	■■■□□ 2.33
LETMD1-224	ENST00000550446	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		29.59	■■■□□ 2.33
LETMD1-224	ENST00000550446	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.57	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		29.56	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	29.56	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29.56	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	PIP4K2B	P78356	416 aa		29.55	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.55	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		29.53	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	TOM1	O60784	492 aa		29.53	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.53	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.53	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.52	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	DAPK1	P53355	1430 aa		29.52	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		29.52	■■■□□ 2.32
LETMD1-224	ENST00000550446	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.51	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	MED14	O60244	1454 aa		29.5	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	CPS1	P31327	1500 aa		29.5	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.49	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		29.47	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	KANK1	Q14678	1352 aa		29.46	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	CEP152	O94986	1710 aa		29.45	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		29.45	■■■□□ 2.31
LETMD1-224	ENST00000550446	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.45	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.44	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.43	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	LTK	P29376	864 aa		29.43	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	HSPA1L	P34931	641 aa		29.43	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		29.42	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	EID1	Q9Y6B2	187 aa		29.4	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		29.4	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
LETMD1-224	ENST00000550446	SOCS7	O14512	581 aa		29.38	■■■□□ 2.29
LETMD1-224	ENST00000550446	IQGAP1	P46940	1657 aa		29.37	■■■□□ 2.29
LETMD1-224	ENST00000550446	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
LETMD1-224	ENST00000550446	IDI1	Q13907	227 aa		29.35	■■■□□ 2.29
LETMD1-224	ENST00000550446	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.34	■■■□□ 2.29
LETMD1-224	ENST00000550446	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
LETMD1-224	ENST00000550446	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		29.3	■■■□□ 2.28
LETMD1-224	ENST00000550446	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		29.29	■■■□□ 2.28
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		29.28	■■■□□ 2.28
LETMD1-224	ENST00000550446	SLIT1	O75093	1534 aa		29.28	■■■□□ 2.28
LETMD1-224	ENST00000550446	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		29.25	■■■□□ 2.27
LETMD1-224	ENST00000550446	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		29.24	■■■□□ 2.27
LETMD1-224	ENST00000550446	ADGRL2	O95490	1459 aa		29.23	■■■□□ 2.27
LETMD1-224	ENST00000550446	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.23	■■■□□ 2.27
LETMD1-224	ENST00000550446	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.22	■■■□□ 2.27
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		29.22	■■■□□ 2.27
LETMD1-224	ENST00000550446	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		29.21	■■■□□ 2.27
LETMD1-224	ENST00000550446	ALK	Q9UM73	1620 aa		29.2	■■■□□ 2.26
LETMD1-224	ENST00000550446	BCAN	Q96GW7	911 aa		29.19	■■■□□ 2.26
LETMD1-224	ENST00000550446	NOS1	P29475	1434 aa		29.19	■■■□□ 2.26
LETMD1-224	ENST00000550446	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.18	■■■□□ 2.26
LETMD1-224	ENST00000550446	SYNM	O15061	1565 aa		29.14	■■■□□ 2.26
LETMD1-224	ENST00000550446	KCNA6	P17658	529 aa		29.14	■■■□□ 2.26
LETMD1-224	ENST00000550446	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	29.14	■■■□□ 2.26
LETMD1-224	ENST00000550446	ITGAE	P38570	1179 aa		29.13	■■■□□ 2.25
LETMD1-224	ENST00000550446	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
LETMD1-224	ENST00000550446	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
LETMD1-224	ENST00000550446	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
LETMD1-224	ENST00000550446	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
LETMD1-224	ENST00000550446	TMEM94	Q12767	1356 aa		29.08	■■■□□ 2.25
LETMD1-224	ENST00000550446	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
LETMD1-224	ENST00000550446	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
LETMD1-224	ENST00000550446	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
LETMD1-224	ENST00000550446	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms