RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550404.1

ANKRD13A-206, Transcript of ankyrin repeat domain 13A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKRD13A, Length 2,350 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13A-206ENST00000550404 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.5■■■□□ 2.15
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ANKRD13A-206ENST00000550404 PDE4AP27815 886 aa28.47■■■□□ 2.15
ANKRD13A-206ENST00000550404 GRIN2AQ12879 1464 aa28.46■■■□□ 2.15
ANKRD13A-206ENST00000550404 BACH2Q9BYV9 841 aa28.46■■■□□ 2.15
ANKRD13A-206ENST00000550404 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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ANKRD13A-206ENST00000550404 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.42■■■□□ 2.14
ANKRD13A-206ENST00000550404 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.42■■■□□ 2.14
ANKRD13A-206ENST00000550404 USP35Q9P2H5 1018 aa28.42■■■□□ 2.14
ANKRD13A-206ENST00000550404 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
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ANKRD13A-206ENST00000550404 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD13A-206ENST00000550404 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ANKRD13A-206ENST00000550404 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
ANKRD13A-206ENST00000550404 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.32■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 LAMC1P11047 1609 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.3■■■□□ 2.12
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ANKRD13A-206ENST00000550404 NEFMP07197 916 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 SYNJ2O15056 1496 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD13A-206ENST00000550404 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
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ANKRD13A-206ENST00000550404 ABCA8O94911 1581 aa28.25■■■□□ 2.11
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ANKRD13A-206ENST00000550404 TSPY10P0CW01 314 aa28.23■■■□□ 2.11
ANKRD13A-206ENST00000550404 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
ANKRD13A-206ENST00000550404 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.21■■■□□ 2.11
ANKRD13A-206ENST00000550404 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.21■■■□□ 2.11
ANKRD13A-206ENST00000550404 CRBNQ96SW2 442 aa28.19■■■□□ 2.1
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ANKRD13A-206ENST00000550404 IL27Q8NEV9 243 aa28.18■■■□□ 2.1
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ANKRD13A-206ENST00000550404 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD13A-206ENST00000550404 PLA2R1Q13018 1463 aa28.12■■■□□ 2.09
ANKRD13A-206ENST00000550404 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.11■■■□□ 2.09
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ANKRD13A-206ENST00000550404 ERBINQ96RT1 1412 aa28.1■■■□□ 2.09
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ANKRD13A-206ENST00000550404 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.1■■■□□ 2.09
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ANKRD13A-206ENST00000550404 JPH4Q96JJ6 628 aa28.08■■■□□ 2.09
ANKRD13A-206ENST00000550404 CHD1O14646 1710 aa28.07■■■□□ 2.08
ANKRD13A-206ENST00000550404 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.07■■■□□ 2.08
ANKRD13A-206ENST00000550404 PREX2Q70Z35 1606 aa28.05■■■□□ 2.08
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ANKRD13A-206ENST00000550404 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.04■■■□□ 2.08
ANKRD13A-206ENST00000550404 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.02■■■□□ 2.08
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ANKRD13A-206ENST00000550404 TMF1P82094 1093 aa28.01■■■□□ 2.07
ANKRD13A-206ENST00000550404 RGL3Q3MIN7 710 aa28.01■■■□□ 2.07
ANKRD13A-206ENST00000550404 NFKBIBQ15653 356 aa27.99■■■□□ 2.07
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ANKRD13A-206ENST00000550404 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.99■■■□□ 2.07
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ANKRD13A-206ENST00000550404 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.99■■■□□ 2.07
ANKRD13A-206ENST00000550404 ZNF521Q96K83 1311 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD13A-206ENST00000550404 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD13A-206ENST00000550404 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.96■■■□□ 2.07
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ANKRD13A-206ENST00000550404 C8orf34Q49A92 452 aa27.95■■■□□ 2.07
ANKRD13A-206ENST00000550404 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ANKRD13A-206ENST00000550404 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.94■■■□□ 2.06
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ANKRD13A-206ENST00000550404 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.9■■■□□ 2.06
ANKRD13A-206ENST00000550404 PPP2R1AP30153 589 aa27.9■■■□□ 2.06
ANKRD13A-206ENST00000550404 IQGAP1P46940 1657 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD13A-206ENST00000550404 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ANKRD13A-206ENST00000550404 SLC4A3P48751 1232 aa27.88■■■□□ 2.05
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