RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544336.5

PDCD2-211, Transcript of programmed cell death 2, human

TSL 1 (best)

Gene PDCD2, Length 1,164 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD2-211	ENST00000544336	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	43.53	■■■■■ 4.56
PDCD2-211	ENST00000544336	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.49	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	PKD2	Q13563	968 aa		43.48	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	43.48	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.48	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	43.47	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	MAP3K1	Q13233	1512 aa		43.46	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		43.45	■■■■■ 4.55
PDCD2-211	ENST00000544336	TNR	Q92752	1358 aa		43.44	■■■■■ 4.54
PDCD2-211	ENST00000544336	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	43.44	■■■■■ 4.54
PDCD2-211	ENST00000544336	PZP	P20742	1482 aa		43.44	■■■■■ 4.54
PDCD2-211	ENST00000544336	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		43.41	■■■■■ 4.54
PDCD2-211	ENST00000544336	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		43.39	■■■■■ 4.54
PDCD2-211	ENST00000544336	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		43.39	■■■■■ 4.54
PDCD2-211	ENST00000544336	MIA2	Q96PC5	1412 aa		43.34	■■■■■ 4.53
PDCD2-211	ENST00000544336	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.33	■■■■■ 4.53
PDCD2-211	ENST00000544336	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
PDCD2-211	ENST00000544336	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.26	■■■■■ 4.52
PDCD2-211	ENST00000544336	ABCC3	O15438	1527 aa		43.24	■■■■■ 4.51
PDCD2-211	ENST00000544336	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.24	■■■■■ 4.51
PDCD2-211	ENST00000544336	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		43.23	■■■■■ 4.51
PDCD2-211	ENST00000544336	APLP2	Q06481	763 aa		43.22	■■■■■ 4.51
PDCD2-211	ENST00000544336	NLRP1	Q9C000	1473 aa		43.2	■■■■■ 4.51
PDCD2-211	ENST00000544336	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.2	■■■■■ 4.51
PDCD2-211	ENST00000544336	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		43.19	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43.19	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	CEP152	O94986	1710 aa		43.18	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.16	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
PDCD2-211	ENST00000544336	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		43.13	■■■■■ 4.49
PDCD2-211	ENST00000544336	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	43.11	■■■■■ 4.49
PDCD2-211	ENST00000544336	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		43.11	■■■■■ 4.49
PDCD2-211	ENST00000544336	ABCC5	O15440	1437 aa		43.09	■■■■■ 4.49
PDCD2-211	ENST00000544336	ERVK-7	P63135	1459 aa		43.08	■■■■■ 4.49
PDCD2-211	ENST00000544336	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.08	■■■■■ 4.49
PDCD2-211	ENST00000544336	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		43.06	■■■■■ 4.48
PDCD2-211	ENST00000544336	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.05	■■■■■ 4.48
PDCD2-211	ENST00000544336	DEPDC5	O75140	1603 aa		43.02	■■■■■ 4.48
PDCD2-211	ENST00000544336	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	43.02	■■■■■ 4.48
PDCD2-211	ENST00000544336	DAPK1	P53355	1430 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PDCD2-211	ENST00000544336	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		43.01	■■■■■ 4.48
PDCD2-211	ENST00000544336	CPS1	P31327	1500 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PDCD2-211	ENST00000544336	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		42.98	■■■■■ 4.47
PDCD2-211	ENST00000544336	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
PDCD2-211	ENST00000544336	MED14	O60244	1454 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PDCD2-211	ENST00000544336	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.97	■■■■■ 4.47
PDCD2-211	ENST00000544336	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		42.96	■■■■■ 4.47
PDCD2-211	ENST00000544336	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	42.94	■■■■■ 4.46
PDCD2-211	ENST00000544336	ILDR2	Q71H61	639 aa		42.93	■■■■■ 4.46
PDCD2-211	ENST00000544336	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.92	■■■■■ 4.46
PDCD2-211	ENST00000544336	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		42.92	■■■■■ 4.46
PDCD2-211	ENST00000544336	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.9	■■■■■ 4.46
PDCD2-211	ENST00000544336	PIP4K2B	P78356	416 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PDCD2-211	ENST00000544336	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		42.84	■■■■■ 4.45
PDCD2-211	ENST00000544336	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		42.83	■■■■■ 4.45
PDCD2-211	ENST00000544336	KANK1	Q14678	1352 aa		42.81	■■■■■ 4.44
PDCD2-211	ENST00000544336	TOM1	O60784	492 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PDCD2-211	ENST00000544336	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.79	■■■■■ 4.44
PDCD2-211	ENST00000544336	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.75	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	PIK3C2B	O00750	1634 aa		42.75	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	LTK	P29376	864 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	HSPA1L	P34931	641 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	SLIT1	O75093	1534 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PDCD2-211	ENST00000544336	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		42.67	■■■■■ 4.42
PDCD2-211	ENST00000544336	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PDCD2-211	ENST00000544336	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PDCD2-211	ENST00000544336	ADGRL2	O95490	1459 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PDCD2-211	ENST00000544336	SYNM	O15061	1565 aa		42.65	■■■■■ 4.42
PDCD2-211	ENST00000544336	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.64	■■■■■ 4.42
PDCD2-211	ENST00000544336	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.62	■■■■■ 4.41
PDCD2-211	ENST00000544336	SOCS7	O14512	581 aa		42.61	■■■■■ 4.41
PDCD2-211	ENST00000544336	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		42.59	■■■■■ 4.41
PDCD2-211	ENST00000544336	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.57	■■■■■ 4.41
PDCD2-211	ENST00000544336	IDI1	Q13907	227 aa		42.56	■■■■■ 4.4
PDCD2-211	ENST00000544336	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.54	■■■■■ 4.4
PDCD2-211	ENST00000544336	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		42.52	■■■■■ 4.4
PDCD2-211	ENST00000544336	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
PDCD2-211	ENST00000544336	NOS1	P29475	1434 aa		42.49	■■■■■ 4.39
PDCD2-211	ENST00000544336	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	42.48	■■■■■ 4.39
PDCD2-211	ENST00000544336	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.46	■■■■■ 4.39
PDCD2-211	ENST00000544336	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
PDCD2-211	ENST00000544336	TET3	O43151	1660 aa		42.39	■■■■■ 4.38
PDCD2-211	ENST00000544336	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.37	■■■■■ 4.37
PDCD2-211	ENST00000544336	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.36	■■■■■ 4.37
PDCD2-211	ENST00000544336	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.35	■■■■■ 4.37
PDCD2-211	ENST00000544336	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PDCD2-211	ENST00000544336	UNC13B	O14795	1591 aa		42.33	■■■■■ 4.37
PDCD2-211	ENST00000544336	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.33	■■■■■ 4.37
PDCD2-211	ENST00000544336	BCAN	Q96GW7	911 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PDCD2-211	ENST00000544336	KCNA6	P17658	529 aa		42.26	■■■■■ 4.36
PDCD2-211	ENST00000544336	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	42.26	■■■■■ 4.36
PDCD2-211	ENST00000544336	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.25	■■■■■ 4.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.5 ms