RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	FCHSD2	O94868	740 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MDM2-231	ENST00000544125	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MDM2-231	ENST00000544125	PTPRE	P23469	700 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MDM2-231	ENST00000544125	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MDM2-231	ENST00000544125	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MDM2-231	ENST00000544125	PTGDR	Q13258	359 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.38	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	HIC1	Q14526	733 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	CERK	Q8TCT0	537 aa		10.36	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	ARHGAP33	O14559	1287 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	GNPAT	O15228	680 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	GPR37	O15354	613 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	ZMYND10	O75800	440 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		10.35	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	COL9A1	P20849	921 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	PBX2	P40425	430 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	PSEN2	P49810	448 aa		10.34	□□□□□ -0.75
MDM2-231	ENST00000544125	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.32	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		10.31	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	FECH	P22830	423 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	PRSS12	P56730	875 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		10.3	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	POTEM	A6NI47	508 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.29	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.28	□□□□□ -0.76
MDM2-231	ENST00000544125	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.27	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		10.26	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.25	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	IRF6	O14896	467 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.24	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	AK7	Q96M32	723 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	TSKS	Q9UJT2	592 aa		10.23	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	TTC13	Q8NBP0	860 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC102A	Q96A19	550 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	FAM161A	Q3B820	660 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MDM2-231	ENST00000544125	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	TK2	O00142	265 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	OAT	P04181	439 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	PNMA3	Q9UL41	463 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	TATDN2	Q93075	761 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	SMAP	O00193	183 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	STAC3	Q96MF2	364 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM66	O15016	1216 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	NBPF3	Q9H094	633 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MDM2-231	ENST00000544125	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	EYA1	Q99502	592 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	PHOX2B	Q99453	314 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	PDE4D	Q08499	809 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	HR	O43593	1189 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	DNAJB2	P25686	324 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	AMHR2	Q16671	573 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	NLRP7	Q8WX94	980 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MDM2-231	ENST00000544125	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	NEUROD2	Q15784	382 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		10.08	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	CLCN1	P35523	988 aa		10.06	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		10.04	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MDM2-231	ENST00000544125	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8

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