RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542663.1

CLSTN3-214, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CLSTN3, Length 390 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-214ENST00000542663 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.8■■■□□ 2.2
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CLSTN3-214ENST00000542663 NLRP1Q9C000 1473 aa28.63■■■□□ 2.17
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CLSTN3-214ENST00000542663 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28■■■□□ 2.07
CLSTN3-214ENST00000542663 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CLSTN3-214ENST00000542663 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.98■■■□□ 2.07
CLSTN3-214ENST00000542663 KCNA6P17658 529 aa27.98■■■□□ 2.07
CLSTN3-214ENST00000542663 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.97■■■□□ 2.07
CLSTN3-214ENST00000542663 ADGRL2O95490 1459 aa27.96■■■□□ 2.07
CLSTN3-214ENST00000542663 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
CLSTN3-214ENST00000542663 APLP2Q06481 763 aa27.93■■■□□ 2.06
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