RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.6■□□□□ 0.57
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CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CLSTN3-211ENST00000541667 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.57■□□□□ 0.56
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CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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CLSTN3-211ENST00000541667 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.44■□□□□ 0.54
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CLSTN3-211ENST00000541667 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
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CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.41■□□□□ 0.54
CLSTN3-211ENST00000541667 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.4■□□□□ 0.54
CLSTN3-211ENST00000541667 CEP152O94986 1710 aa18.4■□□□□ 0.54
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CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.39■□□□□ 0.53
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CLSTN3-211ENST00000541667 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.33■□□□□ 0.52
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CLSTN3-211ENST00000541667 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.31■□□□□ 0.52
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CLSTN3-211ENST00000541667 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.3■□□□□ 0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 KANK1Q14678 1352 aa18.3■□□□□ 0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.28■□□□□ 0.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SLIT1O75093 1534 aa18.28■□□□□ 0.52
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CLSTN3-211ENST00000541667 CPS1P31327 1500 aa18.27■□□□□ 0.51
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CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.24■□□□□ 0.51
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CLSTN3-211ENST00000541667 ROCK1Q13464 1354 aa18.22■□□□□ 0.51
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CLSTN3-211ENST00000541667 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.2■□□□□ 0.5
CLSTN3-211ENST00000541667 TOM1O60784 492 aa18.19■□□□□ 0.5
CLSTN3-211ENST00000541667 ILDR2Q71H61 639 aa18.18■□□□□ 0.5
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CLSTN3-211ENST00000541667 HSPA1LP34931 641 aa18.15■□□□□ 0.5
CLSTN3-211ENST00000541667 UNC13BO14795 1591 aa18.14■□□□□ 0.49
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CLSTN3-211ENST00000541667 ADGRB3O60242 1522 aa18.12■□□□□ 0.49
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC26A8Q96RN1 970 aa18.11■□□□□ 0.49
CLSTN3-211ENST00000541667 ZFYVE9O95405 1425 aa18.1■□□□□ 0.49
CLSTN3-211ENST00000541667 KCNA6P17658 529 aa18.1■□□□□ 0.49
CLSTN3-211ENST00000541667 NUP155O75694 1391 aa18.09■□□□□ 0.49
CLSTN3-211ENST00000541667 E9PCH4 1651 aa18.09■□□□□ 0.49
CLSTN3-211ENST00000541667 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.09■□□□□ 0.49
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CLSTN3-211ENST00000541667 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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