RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.97■■■□□ 2.23
PACSIN3-211ENST00000539589 RAPGEF3O95398 923 aa28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-211ENST00000539589 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-211ENST00000539589 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.96■■■□□ 2.23
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PACSIN3-211ENST00000539589 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.94■■■□□ 2.222e-6■□□□□ 10.8
PACSIN3-211ENST00000539589 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PACSIN3-211ENST00000539589 DEPDC5O75140 1603 aa28.92■■■□□ 2.22
PACSIN3-211ENST00000539589 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-211ENST00000539589 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.91■■■□□ 2.22
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCA6Q8N139 1617 aa28.9■■■□□ 2.22
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
PACSIN3-211ENST00000539589 A2MP01023 1474 aa28.86■■■□□ 2.21
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.86■■■□□ 2.21
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.84■■■□□ 2.21
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF3BO15066 747 aa28.82■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.82■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.8■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.79■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.78■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.77■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 PLA2R1Q13018 1463 aa28.77■■■□□ 2.2
PACSIN3-211ENST00000539589 E9PCH4 1651 aa28.76■■■□□ 2.19
PACSIN3-211ENST00000539589 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
PACSIN3-211ENST00000539589 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.75■■■□□ 2.19
PACSIN3-211ENST00000539589 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
PACSIN3-211ENST00000539589 TET3O43151 1660 aa28.73■■■□□ 2.19
PACSIN3-211ENST00000539589 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PACSIN3-211ENST00000539589 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.69■■■□□ 2.18
PACSIN3-211ENST00000539589 KANK1Q14678 1352 aa28.68■■■□□ 2.18
PACSIN3-211ENST00000539589 ATP10AO60312 1499 aa28.68■■■□□ 2.18
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP152O94986 1710 aa28.68■■■□□ 2.18
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.62■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.62■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.62■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.61■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 GGT6Q6P531 493 aa28.6■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.59■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRTO14522 1441 aa28.58■■■□□ 2.17
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPM2O94759 1503 aa28.56■■■□□ 2.16
PACSIN3-211ENST00000539589 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.55■■■□□ 2.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC3O15438 1527 aa28.54■■■□□ 2.16
PACSIN3-211ENST00000539589 REREQ9P2R6 1566 aa28.54■■■□□ 2.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
PACSIN3-211ENST00000539589 CLTCL1P53675 1640 aa28.52■■■□□ 2.16
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.5■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.49■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.48■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 NPATQ14207 1427 aa28.47■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.47■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 AGLP35573 1532 aa28.46■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.46■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 RGL3Q3MIN7 710 aa28.45■■■□□ 2.15
PACSIN3-211ENST00000539589 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.45■■■□□ 2.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PACSIN3-211ENST00000539589 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.44■■■□□ 2.14
PACSIN3-211ENST00000539589 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.43■■■□□ 2.14
PACSIN3-211ENST00000539589 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.42■■■□□ 2.14
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF1BO60333 1816 aa28.36■■■□□ 2.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ANP32CO43423 234 aa28.36■■■□□ 2.13
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.35■■■□□ 2.13
PACSIN3-211ENST00000539589 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.34■■■□□ 2.13
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.34■■■□□ 2.13
PACSIN3-211ENST00000539589 NOS1P29475 1434 aa28.33■■■□□ 2.13
PACSIN3-211ENST00000539589 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.32■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MROH2AA6NES4 1674 aa28.32■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.31■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.31■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 SYNMO15061 1565 aa28.31■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.29■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 CCER2I3L3R5 266 aa28.28■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.27■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3C2BO00750 1634 aa28.27■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 MLECQ14165 292 aa28.26■■■□□ 2.12
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.25■■■□□ 2.11
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRB3O60242 1522 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-211ENST00000539589 IFT172Q9UG01 1749 aa28.24■■■□□ 2.11
PACSIN3-211ENST00000539589 MADDQ8WXG6 1647 aa28.23■■■□□ 2.11
PACSIN3-211ENST00000539589 USP47Q96K76 1375 aa28.2■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.19■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.19■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC7Q96M83 1385 aa28.18■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ERVK-7P63135 1459 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.15■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 PPLO60437 1756 aa28.14■■■□□ 2.1
PACSIN3-211ENST00000539589 STAC3Q96MF2 364 aa28.14■■■□□ 2.09
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