RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527449.1

RBM25-206, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 1 (best)

Gene RBM25, Length 3,469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-206	ENST00000527449	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	PTPRK	Q15262	1439 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	IQGAP1	P46940	1657 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	KDM5C	P41229	1560 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		5	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	NAIP	Q13075	1403 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	PIK3C2B	O00750	1634 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	MYOM1	P52179	1685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	RGS20	O76081	388 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	UACA	Q9BZF9	1416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	PZP	P20742	1482 aa		4.96	□□□□□ -1.61
RBM25-206	ENST00000527449	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	USP32	Q8NFA0	1604 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ABCC2	Q92887	1545 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ERCC6	Q03468	1493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ABCC1	P33527	1531 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	TET3	O43151	1660 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	MADD	Q8WXG6	1647 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	SYNM	O15061	1565 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	METRN	Q9UJH8	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	IFFO2	Q5TF58	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	OCEL1	Q9H607	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	GLI2	P10070	1586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	DAPK1	P53355	1430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	FAM212A	Q96EL1	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	PPL	O60437	1756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	CHADL	Q6NUI6	762 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	ABCC5	O15440	1437 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RBM25-206	ENST00000527449	INSR	P06213	1382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	POTEF	A5A3E0	1075 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	SOX12	O15370	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	TRPM2	O94759	1503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM25-206	ENST00000527449	ATP10B	O94823	1461 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms