RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524719.1

TSTA3-202, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 3

Gene TSTA3, Length 762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-202ENST00000524719 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.82■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 APLP2Q06481 763 aa21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.79■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.79■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.78■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.77■■□□□ 1.08
TSTA3-202ENST00000524719 TNRQ92752 1358 aa21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.74■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 SOCS7O14512 581 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.73■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 MIA2Q96PC5 1412 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 PZPP20742 1482 aa21.72■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 TSPY4P0CV99 314 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 TSPY10P0CW01 314 aa21.71■■□□□ 1.07
TSTA3-202ENST00000524719 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.69■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.68■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.65■■□□□ 1.06
TSTA3-202ENST00000524719 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 NLRP1Q9C000 1473 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.62■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 PIP4K2BP78356 416 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.61■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 CPS1P31327 1500 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.6■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 TOM1O60784 492 aa21.58■■□□□ 1.05
TSTA3-202ENST00000524719 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 ABCC3O15438 1527 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 HSPA1LP34931 641 aa21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.54■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 MED14O60244 1454 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 DEPDC5O75140 1603 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 DAPK1P53355 1430 aa21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 ABCC5O15440 1437 aa21.52■■□□□ 1.04
TSTA3-202ENST00000524719 ERVK-7P63135 1459 aa21.52■■□□□ 1.03
TSTA3-202ENST00000524719 IQGAP1P46940 1657 aa21.5■■□□□ 1.03
TSTA3-202ENST00000524719 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.49■■□□□ 1.03
TSTA3-202ENST00000524719 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-202ENST00000524719 CEP152O94986 1710 aa21.48■■□□□ 1.03
TSTA3-202ENST00000524719 KIF15Q9NS87 1388 aa21.47■■□□□ 1.03
TSTA3-202ENST00000524719 ERBINQ96RT1 1412 aa21.45■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 ALKQ9UM73 1620 aa21.42■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.4■■□□□ 1.02
TSTA3-202ENST00000524719 LTKP29376 864 aa21.39■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.38■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 ADGRL2O95490 1459 aa21.38■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.38■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 SYNMO15061 1565 aa21.36■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 EID1Q9Y6B2 187 aa21.36■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.35■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 KANK1Q14678 1352 aa21.35■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 SLIT1O75093 1534 aa21.34■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.34■■□□□ 1.01
TSTA3-202ENST00000524719 PIK3C2BO00750 1634 aa21.31■■□□□ 1
TSTA3-202ENST00000524719 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
TSTA3-202ENST00000524719 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.3■■□□□ 1
TSTA3-202ENST00000524719 IDI1Q13907 227 aa21.28■■□□□ 1
TSTA3-202ENST00000524719 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.25■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.25■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.25■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.22■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 UNC13BO14795 1591 aa21.22■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 TMEM94Q12767 1356 aa21.21■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 ROCK1Q13464 1354 aa21.21■□□□□ 0.99
TSTA3-202ENST00000524719 KCNA6P17658 529 aa21.2■□□□□ 0.98
TSTA3-202ENST00000524719 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
TSTA3-202ENST00000524719 NOS1P29475 1434 aa21.2■□□□□ 0.98
TSTA3-202ENST00000524719 TET3O43151 1660 aa21.19■□□□□ 0.98
TSTA3-202ENST00000524719 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.19■□□□□ 0.98
TSTA3-202ENST00000524719 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
TSTA3-202ENST00000524719 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
TSTA3-202ENST00000524719 BCANQ96GW7 911 aa21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms