RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa30.89■■■□□ 2.54
RPS20-210ENST00000523936 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
RPS20-210ENST00000523936 RSPH4AQ5TD94 716 aa30.86■■■□□ 2.53
RPS20-210ENST00000523936 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.86■■■□□ 2.53
RPS20-210ENST00000523936 KIF3BO15066 747 aa30.84■■■□□ 2.53
RPS20-210ENST00000523936 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.83■■■□□ 2.53
RPS20-210ENST00000523936 PZPP20742 1482 aa30.83■■■□□ 2.53
RPS20-210ENST00000523936 TNRQ92752 1358 aa30.8■■■□□ 2.52
RPS20-210ENST00000523936 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.79■■■□□ 2.52
RPS20-210ENST00000523936 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
RPS20-210ENST00000523936 UBAP1LF5GYI3 381 aa30.77■■■□□ 2.52
RPS20-210ENST00000523936 SOCS7O14512 581 aa30.77■■■□□ 2.52
RPS20-210ENST00000523936 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.74■■■□□ 2.51
RPS20-210ENST00000523936 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
RPS20-210ENST00000523936 MAST1Q9Y2H9 1570 aa30.71■■■□□ 2.51
RPS20-210ENST00000523936 TSPY4P0CV99 314 aa30.7■■■□□ 2.51
RPS20-210ENST00000523936 TSPY10P0CW01 314 aa30.7■■■□□ 2.51
RPS20-210ENST00000523936 MIA2Q96PC5 1412 aa30.7■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.7■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 NLRP1Q9C000 1473 aa30.7■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 CPS1P31327 1500 aa30.69■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.68■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.66■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 DEPDC5O75140 1603 aa30.66■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.66■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.65■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.65■■■□□ 2.51e-7■□□□□ 9
RPS20-210ENST00000523936 ANKLE2Q86XL3 938 aa30.64■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
RPS20-210ENST00000523936 MED14O60244 1454 aa30.63■■■□□ 2.49
RPS20-210ENST00000523936 ABCC3O15438 1527 aa30.62■■■□□ 2.49
RPS20-210ENST00000523936 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.62■■■□□ 2.49
RPS20-210ENST00000523936 MAP3K1Q13233 1512 aa30.61■■■□□ 2.49
RPS20-210ENST00000523936 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.58■■■□□ 2.49
RPS20-210ENST00000523936 IQGAP1P46940 1657 aa30.57■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 CEP152O94986 1710 aa30.55■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 TOM1O60784 492 aa30.54■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.54■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 ERVK-7P63135 1459 aa30.53■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
RPS20-210ENST00000523936 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.5■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.49■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 UBR1Q8IWV7 1749 aa30.49■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.48■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 HSPA1LP34931 641 aa30.48■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 ALKQ9UM73 1620 aa30.47■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 PIP4K2BP78356 416 aa30.47■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 CROCC2H7BZ55 1655 aa30.46■■■□□ 2.47
RPS20-210ENST00000523936 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
RPS20-210ENST00000523936 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
RPS20-210ENST00000523936 SYNMO15061 1565 aa30.41■■■□□ 2.46
RPS20-210ENST00000523936 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.39■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 LRRC7Q96NW7 1537 aa30.38■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 ERBINQ96RT1 1412 aa30.37■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 PTPN23Q9H3S7 1636 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 KIF15Q9NS87 1388 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 ABCC5O15440 1437 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 ARHGAP23Q9P227 1491 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 SLIT1O75093 1534 aa30.36■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
RPS20-210ENST00000523936 PIK3C2BO00750 1634 aa30.29■■■□□ 2.44
RPS20-210ENST00000523936 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.29■■■□□ 2.44
RPS20-210ENST00000523936 LTKP29376 864 aa30.28■■■□□ 2.44
RPS20-210ENST00000523936 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.28■■■□□ 2.44
RPS20-210ENST00000523936 DAPK1P53355 1430 aa30.28■■■□□ 2.44
RPS20-210ENST00000523936 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
RPS20-210ENST00000523936 TXNDC2Q86VQ3 553 aa30.25■■■□□ 2.43
RPS20-210ENST00000523936 FGD6Q6ZV73 1430 aa30.22■■■□□ 2.43
RPS20-210ENST00000523936 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.22■■■□□ 2.43
RPS20-210ENST00000523936 KANK1Q14678 1352 aa30.2■■■□□ 2.43
RPS20-210ENST00000523936 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.439e-14■□□□□ 10.5
RPS20-210ENST00000523936 APLP2Q06481 763 aa30.19■■■□□ 2.42
RPS20-210ENST00000523936 EID1Q9Y6B2 187 aa30.19■■■□□ 2.42
RPS20-210ENST00000523936 TMEM2Q9UHN6 1383 aa30.18■■■□□ 2.42
RPS20-210ENST00000523936 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.16■■■□□ 2.42
RPS20-210ENST00000523936 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.16■■■□□ 2.42
RPS20-210ENST00000523936 IDI1Q13907 227 aa30.11■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 STAG3Q9UJ98 1225 aa30.1■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.1■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 NOS1P29475 1434 aa30.1■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 TET3O43151 1660 aa30.1■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 ADGRL2O95490 1459 aa30.08■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
RPS20-210ENST00000523936 ADGRB3O60242 1522 aa30.06■■■□□ 2.4
RPS20-210ENST00000523936 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.03■■■□□ 2.4
RPS20-210ENST00000523936 KCNA6P17658 529 aa30.02■■■□□ 2.4
RPS20-210ENST00000523936 TMEM94Q12767 1356 aa30.01■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 NWD1Q149M9 1564 aa30■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 MYO5BQ9ULV0 1848 aa30■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.99■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.97■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.96■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
RPS20-210ENST00000523936 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms