RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523077.1

HSF4-223, Transcript of heat shock transcription factor 4, human

TSL 2

Gene HSF4, Length 828 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HSF4-223	ENST00000523077	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
HSF4-223	ENST00000523077	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		29.02	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
HSF4-223	ENST00000523077	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.01	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.99	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		28.98	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	PKD2	Q13563	968 aa		28.98	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	CEP152	O94986	1710 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HSF4-223	ENST00000523077	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		28.95	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		28.94	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	KIF3B	O15066	747 aa		28.93	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		28.92	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	SOCS7	O14512	581 aa		28.91	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	TNR	Q92752	1358 aa		28.9	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	PZP	P20742	1482 aa		28.89	■■■□□ 2.22
HSF4-223	ENST00000523077	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.86	■■■□□ 2.21
HSF4-223	ENST00000523077	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.86	■■■□□ 2.21
HSF4-223	ENST00000523077	TSPY4	P0CV99	314 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HSF4-223	ENST00000523077	TSPY10	P0CW01	314 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HSF4-223	ENST00000523077	ABCC3	O15438	1527 aa		28.84	■■■□□ 2.21
HSF4-223	ENST00000523077	ABCC5	O15440	1437 aa		28.83	■■■□□ 2.21
HSF4-223	ENST00000523077	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		28.83	■■■□□ 2.21
HSF4-223	ENST00000523077	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28.82	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.81	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	APLP2	Q06481	763 aa		28.8	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	DAPK1	P53355	1430 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	28.79	■■■□□ 2.2	3e-7	■□□□□ 9.3
HSF4-223	ENST00000523077	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		28.78	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	CPS1	P31327	1500 aa		28.77	■■■□□ 2.2
HSF4-223	ENST00000523077	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.75	■■■□□ 2.19
HSF4-223	ENST00000523077	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.75	■■■□□ 2.19
HSF4-223	ENST00000523077	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.74	■■■□□ 2.19
HSF4-223	ENST00000523077	NLRP1	Q9C000	1473 aa		28.73	■■■□□ 2.19
HSF4-223	ENST00000523077	KIF15	Q9NS87	1388 aa		28.73	■■■□□ 2.19
HSF4-223	ENST00000523077	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.7	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.69	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		28.69	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	28.69	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	HSPA1L	P34931	641 aa		28.68	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.66	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.66	■■■□□ 2.18
HSF4-223	ENST00000523077	TOM1	O60784	492 aa		28.63	■■■□□ 2.17
HSF4-223	ENST00000523077	MED14	O60244	1454 aa		28.63	■■■□□ 2.17
HSF4-223	ENST00000523077	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.62	■■■□□ 2.17
HSF4-223	ENST00000523077	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.62	■■■□□ 2.17
HSF4-223	ENST00000523077	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		28.61	■■■□□ 2.17
HSF4-223	ENST00000523077	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
HSF4-223	ENST00000523077	SYNM	O15061	1565 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HSF4-223	ENST00000523077	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HSF4-223	ENST00000523077	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HSF4-223	ENST00000523077	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.54	■■■□□ 2.16
HSF4-223	ENST00000523077	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HSF4-223	ENST00000523077	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HSF4-223	ENST00000523077	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.52	■■■□□ 2.16
HSF4-223	ENST00000523077	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	28.48	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	UNC13B	O14795	1591 aa		28.47	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		28.46	■■■□□ 2.15
HSF4-223	ENST00000523077	TET3	O43151	1660 aa		28.45	■■■□□ 2.14
HSF4-223	ENST00000523077	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.44	■■■□□ 2.14
HSF4-223	ENST00000523077	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
HSF4-223	ENST00000523077	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.41	■■■□□ 2.14
HSF4-223	ENST00000523077	KANK1	Q14678	1352 aa		28.4	■■■□□ 2.14
HSF4-223	ENST00000523077	SLIT1	O75093	1534 aa		28.4	■■■□□ 2.14
HSF4-223	ENST00000523077	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.4	■■■□□ 2.14
HSF4-223	ENST00000523077	LTK	P29376	864 aa		28.38	■■■□□ 2.13
HSF4-223	ENST00000523077	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.37	■■■□□ 2.13
HSF4-223	ENST00000523077		E9PCH4	1651 aa		28.37	■■■□□ 2.13
HSF4-223	ENST00000523077	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.34	■■■□□ 2.13
HSF4-223	ENST00000523077	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
HSF4-223	ENST00000523077	NOS1	P29475	1434 aa		28.34	■■■□□ 2.13
HSF4-223	ENST00000523077	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.32	■■■□□ 2.12
HSF4-223	ENST00000523077	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.29	■■■□□ 2.12
HSF4-223	ENST00000523077	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.29	■■■□□ 2.12
HSF4-223	ENST00000523077	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.28	■■■□□ 2.12
HSF4-223	ENST00000523077	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.28	■■■□□ 2.12
HSF4-223	ENST00000523077	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.27	■■■□□ 2.12
HSF4-223	ENST00000523077	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.23	■■■□□ 2.11
HSF4-223	ENST00000523077	IDI1	Q13907	227 aa		28.2	■■■□□ 2.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.7 ms