RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-209ENST00000522928 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.53□□□□□ -0.88
CLVS1-209ENST00000522928 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 COL9A1P20849 921 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 PSEN2P49810 448 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 FBXW7Q969H0 707 aa9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.5□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 GPR37O15354 613 aa9.48□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP33O14559 1287 aa9.47□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 KCNK17Q96T54 332 aa9.47□□□□□ -0.89
CLVS1-209ENST00000522928 PBX2P40425 430 aa9.46□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 MAP3K7O43318 606 aa9.45□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 BCANQ96GW7 911 aa9.44□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.44□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 PTPREP23469 700 aa9.43□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.43□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 PTGDRQ13258 359 aa9.42□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa9.41□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 C3orf80F5H4A9 247 aa9.41□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.41□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 PROX2Q3B8N5 592 aa9.4□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.4□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 TTC13Q8NBP0 860 aa9.4□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.4□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.4□□□□□ -0.9
CLVS1-209ENST00000522928 NUTM2FA1L443 756 aa9.38□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 HRO43593 1189 aa9.38□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 FECHP22830 423 aa9.38□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.38□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 TSKSQ9UJT2 592 aa9.38□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 PRSS12P56730 875 aa9.36□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRD1Q6QNK2 874 aa9.36□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 TK2O00142 265 aa9.35□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.35□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.35□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.33□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 FCHSD2O94868 740 aa9.33□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 PADI6Q6TGC4 694 aa9.33□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.33□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 CERKQ8TCT0 537 aa9.33□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.32□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 GNPATO15228 680 aa9.3□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 ZMYND10O75800 440 aa9.3□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 HIC1Q14526 733 aa9.3□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 FAM161AQ3B820 660 aa9.3□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.29□□□□□ -0.92
CLVS1-209ENST00000522928 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 KCNH8Q96L42 1107 aa9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 EYA1Q99502 592 aa9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 BARGINQ6ZT62 677 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 PHOX2BQ99453 314 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 SMAPO00193 183 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 TATDN2Q93075 761 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.23□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 PACS2Q86VP3 889 aa9.23□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 IRF6O14896 467 aa9.22□□□□□ -0.93
CLVS1-209ENST00000522928 MAP2K5Q13163 448 aa9.21□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.2□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 PNMA3Q9UL41 463 aa9.2□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.19□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 HCSTQ9UBK5 93 aa9.18□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 NBPF26B4DH59 902 aa9.17□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 NLRP7Q8WX94 980 aa9.17□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC102AQ96A19 550 aa9.17□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 NBPF3Q9H094 633 aa9.17□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 RCCD1A6NED2 376 aa9.15□□□□□ -0.94
CLVS1-209ENST00000522928 OATP04181 439 aa9.14□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.14□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 SLC24A3Q9HC58 644 aa9.14□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.13□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.12□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.12□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 TRIM66O15016 1216 aa9.11□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.1□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 BCAMP50895 628 aa9.1□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.1□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 WNT2BQ93097 391 aa9.1□□□□□ -0.95
CLVS1-209ENST00000522928 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
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