RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521644.5

ERLIN2-208, Transcript of ER lipid raft associated 2, human

TSL 5

Gene ERLIN2, Length 1,602 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERLIN2-208	ENST00000521644	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		28.31	■■■□□ 2.12
ERLIN2-208	ENST00000521644	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.3	■■■□□ 2.12
ERLIN2-208	ENST00000521644	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.3	■■■□□ 2.12	3e-6	■■□□□ 12.8
ERLIN2-208	ENST00000521644	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
ERLIN2-208	ENST00000521644	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.27	■■■□□ 2.12
ERLIN2-208	ENST00000521644	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.25	■■■□□ 2.11
ERLIN2-208	ENST00000521644	KANK1	Q14678	1352 aa		28.25	■■■□□ 2.11
ERLIN2-208	ENST00000521644	RICTOR	Q6R327	1708 aa		28.22	■■■□□ 2.11
ERLIN2-208	ENST00000521644	A2M	P01023	1474 aa		28.21	■■■□□ 2.11
ERLIN2-208	ENST00000521644	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		28.19	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	TET3	O43151	1660 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	ATP10A	O60312	1499 aa		28.18	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIF3B	O15066	747 aa		28.17	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		28.16	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	ABCA6	Q8N139	1617 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.15	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
ERLIN2-208	ENST00000521644	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644		E9PCH4	1651 aa		28.13	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.12	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.11	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	RAPGEF3	O95398	923 aa		28.1	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		28.09	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	PLA2R1	Q13018	1463 aa		28.08	■■■□□ 2.09
ERLIN2-208	ENST00000521644	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.06	■■■□□ 2.08
ERLIN2-208	ENST00000521644	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		28.05	■■■□□ 2.08
ERLIN2-208	ENST00000521644	TRPM2	O94759	1503 aa		28.04	■■■□□ 2.08
ERLIN2-208	ENST00000521644	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.03	■■■□□ 2.08
ERLIN2-208	ENST00000521644	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ERLIN2-208	ENST00000521644	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ERLIN2-208	ENST00000521644	PTPRT	O14522	1441 aa		28	■■■□□ 2.07
ERLIN2-208	ENST00000521644	CEP152	O94986	1710 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ERLIN2-208	ENST00000521644	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	RERE	Q9P2R6	1566 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	GGT6	Q6P531	493 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	CLTCL1	P53675	1640 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ERLIN2-208	ENST00000521644	ABCC3	O15438	1527 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	MIER1	Q8N108	512 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	RGL3	Q3MIN7	710 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	STAC3	Q96MF2	364 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIF1B	O60333	1816 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ERLIN2-208	ENST00000521644	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	AGL	P35573	1532 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	NPAT	Q14207	1427 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	USP47	Q96K76	1375 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	LAMC1	P11047	1609 aa		27.77	■■■□□ 2.04
ERLIN2-208	ENST00000521644	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		27.74	■■■□□ 2.03
ERLIN2-208	ENST00000521644	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
ERLIN2-208	ENST00000521644	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
ERLIN2-208	ENST00000521644	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ERLIN2-208	ENST00000521644	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		27.71	■■■□□ 2.03
ERLIN2-208	ENST00000521644	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		27.7	■■■□□ 2.03
ERLIN2-208	ENST00000521644	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		27.7	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	NOS1	P29475	1434 aa		27.69	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	CCDC7	Q96M83	1385 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	ADGRB3	O60242	1522 aa		27.68	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.66	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	IFT172	Q9UG01	1749 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	MYOM2	P54296	1465 aa		27.66	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	MROH2A	A6NES4	1674 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		27.65	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.64	■■■□□ 2.02
ERLIN2-208	ENST00000521644	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ERLIN2-208	ENST00000521644	ANP32C	O43423	234 aa		27.62	■■■□□ 2.01
ERLIN2-208	ENST00000521644	SYNM	O15061	1565 aa		27.6	■■■□□ 2.01
ERLIN2-208	ENST00000521644	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.59	■■■□□ 2.01
ERLIN2-208	ENST00000521644	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		27.57	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		27.57	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		27.56	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	PPL	O60437	1756 aa		27.56	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		27.55	■■■□□ 2
ERLIN2-208	ENST00000521644	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms