RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518924.1

KRT18P41-201, Transcript of keratin 18 pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene KRT18P41, Length 1,277 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P41-201ENST00000518924 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
KRT18P41-201ENST00000518924 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.36■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.35■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 TRIM52Q96A61 297 aa27.34■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.34■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 ATP10AO60312 1499 aa27.33■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 NUP155O75694 1391 aa27.33■■□□□ 1.97
KRT18P41-201ENST00000518924 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.33■■□□□ 1.96
KRT18P41-201ENST00000518924 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.32■■□□□ 1.96
KRT18P41-201ENST00000518924 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.31■■□□□ 1.96
KRT18P41-201ENST00000518924 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.31■■□□□ 1.96
KRT18P41-201ENST00000518924 AGLP35573 1532 aa27.31■■□□□ 1.96
KRT18P41-201ENST00000518924 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
KRT18P41-201ENST00000518924 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.24■■□□□ 1.95
KRT18P41-201ENST00000518924 TET3O43151 1660 aa27.24■■□□□ 1.95
KRT18P41-201ENST00000518924 KIF3BO15066 747 aa27.22■■□□□ 1.95
KRT18P41-201ENST00000518924 KANK1Q14678 1352 aa27.21■■□□□ 1.95
KRT18P41-201ENST00000518924 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.21■■□□□ 1.95
KRT18P41-201ENST00000518924 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
KRT18P41-201ENST00000518924 PKD2Q13563 968 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT18P41-201ENST00000518924 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT18P41-201ENST00000518924 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.15■■□□□ 1.94
KRT18P41-201ENST00000518924 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.13■■□□□ 1.93
KRT18P41-201ENST00000518924 E9PCH4 1651 aa27.13■■□□□ 1.93
KRT18P41-201ENST00000518924 CEP152O94986 1710 aa27.12■■□□□ 1.93
KRT18P41-201ENST00000518924 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.11■■□□□ 1.93
KRT18P41-201ENST00000518924 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
KRT18P41-201ENST00000518924 ABCC3O15438 1527 aa27.11■■□□□ 1.93
KRT18P41-201ENST00000518924 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
KRT18P41-201ENST00000518924 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.05■■□□□ 1.92
KRT18P41-201ENST00000518924 PTPRTO14522 1441 aa27.05■■□□□ 1.92
KRT18P41-201ENST00000518924 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.05■■□□□ 1.92
KRT18P41-201ENST00000518924 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.05■■□□□ 1.92
KRT18P41-201ENST00000518924 PLA2R1Q13018 1463 aa27.02■■□□□ 1.92
KRT18P41-201ENST00000518924 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.02■■□□□ 1.92
KRT18P41-201ENST00000518924 FOXD1Q16676 465 aa27.01■■□□□ 1.91
KRT18P41-201ENST00000518924 GGT6Q6P531 493 aa27.01■■□□□ 1.91
KRT18P41-201ENST00000518924 TRPM2O94759 1503 aa27■■□□□ 1.91
KRT18P41-201ENST00000518924 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.97■■□□□ 1.91
KRT18P41-201ENST00000518924 NPATQ14207 1427 aa26.95■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.95■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.92■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 MROH2AA6NES4 1674 aa26.92■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 NEUROD1Q13562 356 aa26.91■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 TONSLQ96HA7 1378 aa26.91■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.9■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 NOS1P29475 1434 aa26.9■■□□□ 1.9
KRT18P41-201ENST00000518924 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
KRT18P41-201ENST00000518924 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.86■■□□□ 1.89
KRT18P41-201ENST00000518924 CLTCL1P53675 1640 aa26.86■■□□□ 1.89
KRT18P41-201ENST00000518924 PIK3C2BO00750 1634 aa26.84■■□□□ 1.89
KRT18P41-201ENST00000518924 KIF1BO60333 1816 aa26.83■■□□□ 1.89
KRT18P41-201ENST00000518924 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.81■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.8■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.8■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 SYNMO15061 1565 aa26.8■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 ERVK-7P63135 1459 aa26.78■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.77■■□□□ 1.88
KRT18P41-201ENST00000518924 ZMYM3Q14202 1370 aa26.74■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.74■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 MLECQ14165 292 aa26.73■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 STAC3Q96MF2 364 aa26.73■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.73■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.73■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 ADGRB3O60242 1522 aa26.72■■□□□ 1.87
KRT18P41-201ENST00000518924 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.7■■□□□ 1.86
KRT18P41-201ENST00000518924 C3P01024 1663 aa26.68■■□□□ 1.86
KRT18P41-201ENST00000518924 IFT172Q9UG01 1749 aa26.68■■□□□ 1.86
KRT18P41-201ENST00000518924 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
KRT18P41-201ENST00000518924 MADDQ8WXG6 1647 aa26.64■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.62■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 PPLO60437 1756 aa26.6■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 MYOM2P54296 1465 aa26.6■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.6■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.58■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 IDI1Q13907 227 aa26.58■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
KRT18P41-201ENST00000518924 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.57■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 TNRQ92752 1358 aa26.56■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 NLRP1Q9C000 1473 aa26.55■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.55■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.55■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.55■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.54■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 RGL3Q3MIN7 710 aa26.54■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.54■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.54■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 ZFYVE9O95405 1425 aa26.52■■□□□ 1.84
KRT18P41-201ENST00000518924 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.51■■□□□ 1.83
KRT18P41-201ENST00000518924 LAMC1P11047 1609 aa26.5■■□□□ 1.83
KRT18P41-201ENST00000518924 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.48■■□□□ 1.83
KRT18P41-201ENST00000518924 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms