RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516658.1

RNU6-347P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 347, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-347P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-347P-201ENST00000516658 IFNL1Q8IU54 200 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMC2Q8TDI7 906 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 FECHP22830 423 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 ABL2P42684 1182 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 GLMNQ92990 594 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 MS4A4AQ96JQ5 239 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 SNRKQ9NRH2 765 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 TBC1D12O60347 775 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 OSBPP22059 807 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 RFX1P22670 979 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 RFC5P40937 340 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 OXER1Q8TDS5 423 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-347P-201ENST00000516658 CLK2P49760 499 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 DSG2Q14126 1118 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 VRTNQ9H8Y1 702 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAP3K13O43283 966 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 ERCC3P19447 782 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 PTGDRQ13258 359 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 FOXK1P85037 733 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 DDX12PQ92771 950 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 PTGER2P43116 358 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 WASHC4Q2M389 1173 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 PLPP6Q8IY26 295 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 BCL11AQ9H165 835 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-347P-201ENST00000516658 KIF12Q96FN5 646 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 SOCS7O14512 581 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 OATP04181 439 aa7.01□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 POM121CA8CG34 1229 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 NCLP19338 710 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 CCDC125Q86Z20 511 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 G3V3G9 751 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHADLQ6NUI6 762 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 DRC1Q96MC2 740 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.99□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
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RNU6-347P-201ENST00000516658 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.98□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 AP1G2O75843 785 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 SIRT1Q96EB6 747 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.97□□□□□ -1.29
RNU6-347P-201ENST00000516658 UNCXA6NJT0 531 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 PITPNM1O00562 1244 aa6.96□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 CFAP70Q5T0N1 1121 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.95□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 MAP3K7O43318 606 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 ATG7O95352 703 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 TCF3P15923 654 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 BCL2L13Q9BXK5 485 aa6.93□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 CARNS1A5YM72 827 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 EVI5O60447 810 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 PNMA1Q8ND90 353 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 EPAS1Q99814 870 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.92□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
RNU6-347P-201ENST00000516658 SOX11P35716 441 aa6.91□□□□□ -1.3
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