RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516259.1

RNU6-390P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 390, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-390P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-390P-201ENST00000516259 RIMBP2O15034 1052 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAP3K7O43318 606 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 FECHP22830 423 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 IL27Q8NEV9 243 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 OATP04181 439 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTC13Q8NBP0 860 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 CLCN1P35523 988 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM117AQ9C073 453 aa6.65□□□□□ -1.34
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RNU6-390P-201ENST00000516259 GPR153Q6NV75 609 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
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RNU6-390P-201ENST00000516259 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.62□□□□□ -1.35
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RNU6-390P-201ENST00000516259 ARXQ96QS3 562 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-390P-201ENST00000516259 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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RNU6-390P-201ENST00000516259 PRSS12P56730 875 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-390P-201ENST00000516259 FLIIQ13045 1269 aa6.58□□□□□ -1.36
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RNU6-390P-201ENST00000516259 NUDT7P0C024 238 aa6.57□□□□□ -1.36
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RNU6-390P-201ENST00000516259 ARSIQ5FYB1 569 aa6.57□□□□□ -1.36
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RNU6-390P-201ENST00000516259 PHOX2BQ99453 314 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-390P-201ENST00000516259 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-390P-201ENST00000516259 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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RNU6-390P-201ENST00000516259 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.56□□□□□ -1.36
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RNU6-390P-201ENST00000516259 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-390P-201ENST00000516259 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-390P-201ENST00000516259 EYA1Q99502 592 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-390P-201ENST00000516259 LHX6Q9UPM6 363 aa6.53□□□□□ -1.36
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RNU6-390P-201ENST00000516259 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
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RNU6-390P-201ENST00000516259 SOCS7O14512 581 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-390P-201ENST00000516259 PACS2Q86VP3 889 aa6.49□□□□□ -1.37
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RNU6-390P-201ENST00000516259 CD46P15529 392 aa6.47□□□□□ -1.37
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RNU6-390P-201ENST00000516259 KCNH8Q96L42 1107 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-390P-201ENST00000516259 TSKSQ9UJT2 592 aa6.47□□□□□ -1.37
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RNU6-390P-201ENST00000516259 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 HOMEZQ8IX15 550 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPTLC1O15269 473 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 PBX2P40425 430 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 MCM6Q14566 821 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 USP46P62068 366 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-390P-201ENST00000516259 PNMA3Q9UL41 463 aa6.42□□□□□ -1.38
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