RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.04	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.04	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP10A	O60312	1499 aa		32.02	■■■□□ 2.72
PDE4D-223	ENST00000515011	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32	■■■□□ 2.71
PDE4D-223	ENST00000515011	DEPDC5	O75140	1603 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PDE4D-223	ENST00000515011	KDM5C	P41229	1560 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PDE4D-223	ENST00000515011	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PDE4D-223	ENST00000515011	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PDE4D-223	ENST00000515011	USP47	Q96K76	1375 aa		31.95	■■■□□ 2.71
PDE4D-223	ENST00000515011	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
PDE4D-223	ENST00000515011	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PDE4D-223	ENST00000515011	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011		E9PCH4	1651 aa		31.88	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	CD109	Q6YHK3	1445 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	A2M	P01023	1474 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	TET3	O43151	1660 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PDE4D-223	ENST00000515011	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	TRPM2	O94759	1503 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	KANK1	Q14678	1352 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	PTPRT	O14522	1441 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PDE4D-223	ENST00000515011	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	LAMC1	P11047	1609 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	NEO1	Q92859	1461 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	KIF3B	O15066	747 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	CEP152	O94986	1710 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PDE4D-223	ENST00000515011	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PDE4D-223	ENST00000515011	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PDE4D-223	ENST00000515011	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
PDE4D-223	ENST00000515011	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PDE4D-223	ENST00000515011	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PDE4D-223	ENST00000515011	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	GLI2	P10070	1586 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCA6	Q8N139	1617 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PDE4D-223	ENST00000515011	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PDE4D-223	ENST00000515011	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PDE4D-223	ENST00000515011	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.51	■■■□□ 2.64
PDE4D-223	ENST00000515011	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PDE4D-223	ENST00000515011	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PDE4D-223	ENST00000515011	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PDE4D-223	ENST00000515011	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.45	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	RAPGEF3	O95398	923 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	KIF1B	O60333	1816 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	DIP2B	Q9P265	1576 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	MYOM2	P54296	1465 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCC3	O15438	1527 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	TESK2	Q96S53	571 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PDE4D-223	ENST00000515011	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	NPAT	Q14207	1427 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.35	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	GGT6	Q6P531	493 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PDE4D-223	ENST00000515011	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		31.29	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	TMF1	P82094	1093 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.24	■■■□□ 2.59

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