RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513815.1

LINC00491-204, long intergenic non-protein coding RNA 491, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00491, Length 582 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00491-204ENST00000513815 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 TRIM52Q96A61 297 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.55□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.54□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC1P33527 1531 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 CCDC125Q86Z20 511 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.52□□□□□ -1.2
LINC00491-204ENST00000513815 PRXQ9BXM0 1461 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 NLRP1Q9C000 1473 aa7.52□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ATP7AQ04656 1500 aa7.51□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 PLXNC1O60486 1568 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 TNRQ92752 1358 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 KIF14Q15058 1648 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ARHGAP5Q13017 1502 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 PHLPP1O60346 1717 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 P3H3Q8IVL6 736 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 LRP6O75581 1613 aa7.49□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 SHPRHQ149N8 1683 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 PZPP20742 1482 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 ABCC3O15438 1527 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 RGS12O14924 1447 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.47□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 MIA2Q96PC5 1412 aa7.46□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 NHSL1Q5SYE7 1610 aa7.46□□□□□ -1.21
LINC00491-204ENST00000513815 NWD1Q149M9 1564 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 A2MP01023 1474 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NGLY1Q96IV0 654 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.45□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 YY1P25490 414 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 EP400Q96L91 3159 aa7.44□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 MAP3K1Q13233 1512 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 PREX2Q70Z35 1606 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 TMEM94Q12767 1356 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 CLIP1P30622 1438 aa7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 GGT6Q6P531 493 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SLAIN2Q9P270 581 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 AFF2P51816 1311 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 MSH6P52701 1360 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 KCNA6P17658 529 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 SLIT1O75093 1534 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 TIAM1Q13009 1591 aa7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LINC00491-204ENST00000513815 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa7.39□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 DIP2AQ14689 1571 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.37□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 SETD5Q9C0A6 1442 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 HRCP23327 699 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 EID1Q9Y6B2 187 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 FMN1Q68DA7 1419 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 LTKP29376 864 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 DSG3P32926 999 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00491-204ENST00000513815 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00491-204ENST00000513815 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00491-204ENST00000513815 NCOA2Q15596 1464 aa7.33□□□□□ -1.24
LINC00491-204ENST00000513815 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms