RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 PLA2R1Q13018 1463 aa26.73■■□□□ 1.87
HERC3-211ENST00000513325 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.72■■□□□ 1.87
HERC3-211ENST00000513325 PKD2Q13563 968 aa26.72■■□□□ 1.87
HERC3-211ENST00000513325 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
HERC3-211ENST00000513325 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.7■■□□□ 1.87
HERC3-211ENST00000513325 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.69■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 TNRQ92752 1358 aa26.68■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 PZPP20742 1482 aa26.68■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 MIA2Q96PC5 1412 aa26.67■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 MAST1Q9Y2H9 1570 aa26.66■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HERC3-211ENST00000513325 APLP2Q06481 763 aa26.62■■□□□ 1.85
HERC3-211ENST00000513325 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.61■■□□□ 1.85
HERC3-211ENST00000513325 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HERC3-211ENST00000513325 ABCC3O15438 1527 aa26.55■■□□□ 1.84
HERC3-211ENST00000513325 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HERC3-211ENST00000513325 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
HERC3-211ENST00000513325 NLRP1Q9C000 1473 aa26.53■■□□□ 1.84
HERC3-211ENST00000513325 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HERC3-211ENST00000513325 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.52■■□□□ 1.84
HERC3-211ENST00000513325 ABCC5O15440 1437 aa26.51■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 PTPN23Q9H3S7 1636 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.5■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 KIF15Q9NS87 1388 aa26.48■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa26.48■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.48■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.47■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.46■■□□□ 1.83
HERC3-211ENST00000513325 CROCC2H7BZ55 1655 aa26.45■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 ERVK-7P63135 1459 aa26.45■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 DAPK1P53355 1430 aa26.45■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.45■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 CEP152O94986 1710 aa26.44■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 ERBINQ96RT1 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.42■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 MED14O60244 1454 aa26.39■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.39■■□□□ 1.82
HERC3-211ENST00000513325 DEPDC5O75140 1603 aa26.38■■□□□ 1.81
HERC3-211ENST00000513325 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
HERC3-211ENST00000513325 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HERC3-211ENST00000513325 CPS1P31327 1500 aa26.37■■□□□ 1.81
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.35■■□□□ 1.81
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.34■■□□□ 1.81
HERC3-211ENST00000513325 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.34■■□□□ 1.81
HERC3-211ENST00000513325 KANK1Q14678 1352 aa26.32■■□□□ 1.8
HERC3-211ENST00000513325 IQGAP1P46940 1657 aa26.31■■□□□ 1.8
HERC3-211ENST00000513325 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.31■■□□□ 1.8
HERC3-211ENST00000513325 ILDR2Q71H61 639 aa26.29■■□□□ 1.8
HERC3-211ENST00000513325 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
HERC3-211ENST00000513325 TOM1O60784 492 aa26.27■■□□□ 1.8
HERC3-211ENST00000513325 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
HERC3-211ENST00000513325 PIP4K2BP78356 416 aa26.26■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 LTKP29376 864 aa26.25■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.25■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.23■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.23■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 ADGRL2O95490 1459 aa26.23■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 SLIT1O75093 1534 aa26.22■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 PIK3C2BO00750 1634 aa26.21■■□□□ 1.79
HERC3-211ENST00000513325 HSPA1LP34931 641 aa26.2■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.2■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 STRCP1A6NGW2 1772 aa26.2■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 EID1Q9Y6B2 187 aa26.19■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 IDI1Q13907 227 aa26.18■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.18■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.17■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.16■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.14■■□□□ 1.78
HERC3-211ENST00000513325 ALKQ9UM73 1620 aa26.14■■□□□ 1.77
HERC3-211ENST00000513325 NOS1P29475 1434 aa26.14■■□□□ 1.77
HERC3-211ENST00000513325 SYNMO15061 1565 aa26.13■■□□□ 1.77
HERC3-211ENST00000513325 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
HERC3-211ENST00000513325 SOCS7O14512 581 aa26.09■■□□□ 1.77
HERC3-211ENST00000513325 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.08■■□□□ 1.77
HERC3-211ENST00000513325 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
HERC3-211ENST00000513325 ADGRB3O60242 1522 aa26.04■■□□□ 1.76
HERC3-211ENST00000513325 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.02■■□□□ 1.76
HERC3-211ENST00000513325 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
HERC3-211ENST00000513325 TET3O43151 1660 aa26.01■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 ROCK1Q13464 1354 aa26■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 UNC13BO14795 1591 aa25.99■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 KCNA6P17658 529 aa25.98■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 ITGAEP38570 1179 aa25.98■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 BCANQ96GW7 911 aa25.97■■□□□ 1.75
HERC3-211ENST00000513325 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.95■■□□□ 1.74
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