RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADAMTS12P58397 1594 aa13.19□□□□□ -0.3
MSC-AS1-202ENST00000512290 HECW2Q9P2P5 1572 aa13.19□□□□□ -0.3
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MSC-AS1-202ENST00000512290 POTEBQ6S5H4 581 aa13.17□□□□□ -0.3
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MSC-AS1-202ENST00000512290 ADCY10Q96PN6 1610 aa13.12□□□□□ -0.31
MSC-AS1-202ENST00000512290 SPNS2Q8IVW8 549 aa13.11□□□□□ -0.31
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MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa13.06□□□□□ -0.32
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MSC-AS1-202ENST00000512290 TEX14Q8IWB6 1497 aa13□□□□□ -0.33
MSC-AS1-202ENST00000512290 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
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MSC-AS1-202ENST00000512290 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.99□□□□□ -0.33
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MSC-AS1-202ENST00000512290 KCNH8Q96L42 1107 aa12.99□□□□□ -0.33
MSC-AS1-202ENST00000512290 TNIKQ9UKE5 1360 aa12.98□□□□□ -0.33
MSC-AS1-202ENST00000512290 SOCS7O14512 581 aa12.98□□□□□ -0.33
MSC-AS1-202ENST00000512290 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.98□□□□□ -0.33
MSC-AS1-202ENST00000512290 ABCC2Q92887 1545 aa12.98□□□□□ -0.33
MSC-AS1-202ENST00000512290 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.97□□□□□ -0.33
MSC-AS1-202ENST00000512290 GLI2P10070 1586 aa12.95□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.94□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 ILDR2Q71H61 639 aa12.92□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.91□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 UACAQ9BZF9 1416 aa12.91□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 CUL7Q14999 1698 aa12.91□□□□□ -0.34
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC34A2O95436 690 aa12.89□□□□□ -0.35
MSC-AS1-202ENST00000512290 NUDT7P0C024 238 aa12.89□□□□□ -0.35
MSC-AS1-202ENST00000512290 CERKQ8TCT0 537 aa12.89□□□□□ -0.35
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGF1RP08069 1367 aa12.89□□□□□ -0.35
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.88□□□□□ -0.35
MSC-AS1-202ENST00000512290 CD109Q6YHK3 1445 aa12.87□□□□□ -0.35
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MSC-AS1-202ENST00000512290 HSPA2P54652 639 aa12.85□□□□□ -0.35
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIF27Q86VH2 1401 aa12.85□□□□□ -0.35
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MSC-AS1-202ENST00000512290 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 PTPRMP28827 1452 aa12.83□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 FOXK1P85037 733 aa12.82□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 PLPP6Q8IY26 295 aa12.82□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 LHX6Q9UPM6 363 aa12.81□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 KIF21BO75037 1637 aa12.8□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 KDM5BQ9UGL1 1544 aa12.8□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.79□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 WDR7Q9Y4E6 1490 aa12.78□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARID3CA6NKF2 412 aa12.78□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 DSG2Q14126 1118 aa12.78□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.36
MSC-AS1-202ENST00000512290 RAPGEF3O95398 923 aa12.77□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 IQGAP2Q13576 1575 aa12.76□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa12.75□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 TBC1D12O60347 775 aa12.74□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.74□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP12.72□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 DISP1Q96F81 1524 aa12.72□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 PBX2P40425 430 aa12.71□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 MLECQ14165 292 aa12.71□□□□□ -0.37
MSC-AS1-202ENST00000512290 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 PTGER2P43116 358 aa12.7□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.7□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 CFAP43Q8NDM7 1665 aa12.7□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 ADAMTSL3P82987 1691 aa12.68□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 PHLDB1Q86UU1 1377 aa12.68□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARAP3Q8WWN8 1544 aa12.67□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 PDE4AP27815 886 aa12.67□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.67□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.66□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP12.65□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 MADDQ8WXG6 1647 aa12.65□□□□□ -0.38
MSC-AS1-202ENST00000512290 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa12.64□□□□□ -0.39
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